Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFT4

Arhgap20, Rho GTPase-activating protein 20, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap20Q6IFT4 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Arhgap20Q6IFT4 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Arhgap20Q6IFT4 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Arhgap20Q6IFT4 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Arhgap20Q6IFT4 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Arhgap20Q6IFT4 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Arhgap20Q6IFT4 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Arhgap20Q6IFT4 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Arhgap20Q6IFT4 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Arhgap20Q6IFT4 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Arhgap20Q6IFT4 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Arhgap20Q6IFT4 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Arhgap20Q6IFT4 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Arhgap20Q6IFT4 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Arhgap20Q6IFT4 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Arhgap20Q6IFT4 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Arhgap20Q6IFT4 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Arhgap20Q6IFT4 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Arhgap20Q6IFT4 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Arhgap20Q6IFT4 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Arhgap20Q6IFT4 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Arhgap20Q6IFT4 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Arhgap20Q6IFT4 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Arhgap20Q6IFT4 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Arhgap20Q6IFT4 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Arhgap20Q6IFT4 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Arhgap20Q6IFT4 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Arhgap20Q6IFT4 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Arhgap20Q6IFT4 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Arhgap20Q6IFT4 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Arhgap20Q6IFT4 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Arhgap20Q6IFT4 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Arhgap20Q6IFT4 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Arhgap20Q6IFT4 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Arhgap20Q6IFT4 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Arhgap20Q6IFT4 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Arhgap20Q6IFT4 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Arhgap20Q6IFT4 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Arhgap20Q6IFT4 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Arhgap20Q6IFT4 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Arhgap20Q6IFT4 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Arhgap20Q6IFT4 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Arhgap20Q6IFT4 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Arhgap20Q6IFT4 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Arhgap20Q6IFT4 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Arhgap20Q6IFT4 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Arhgap20Q6IFT4 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Arhgap20Q6IFT4 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Arhgap20Q6IFT4 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Arhgap20Q6IFT4 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Arhgap20Q6IFT4 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Arhgap20Q6IFT4 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Arhgap20Q6IFT4 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Arhgap20Q6IFT4 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Arhgap20Q6IFT4 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Arhgap20Q6IFT4 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Arhgap20Q6IFT4 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Arhgap20Q6IFT4 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Arhgap20Q6IFT4 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Arhgap20Q6IFT4 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Arhgap20Q6IFT4 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Arhgap20Q6IFT4 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Arhgap20Q6IFT4 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Arhgap20Q6IFT4 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Arhgap20Q6IFT4 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Arhgap20Q6IFT4 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Arhgap20Q6IFT4 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Arhgap20Q6IFT4 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Arhgap20Q6IFT4 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Arhgap20Q6IFT4 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Arhgap20Q6IFT4 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Arhgap20Q6IFT4 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Arhgap20Q6IFT4 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Arhgap20Q6IFT4 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Arhgap20Q6IFT4 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Arhgap20Q6IFT4 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Arhgap20Q6IFT4 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Arhgap20Q6IFT4 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Arhgap20Q6IFT4 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Arhgap20Q6IFT4 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Arhgap20Q6IFT4 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Arhgap20Q6IFT4 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Arhgap20Q6IFT4 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Arhgap20Q6IFT4 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Arhgap20Q6IFT4 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Arhgap20Q6IFT4 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Arhgap20Q6IFT4 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Arhgap20Q6IFT4 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Arhgap20Q6IFT4 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Arhgap20Q6IFT4 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Arhgap20Q6IFT4 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Arhgap20Q6IFT4 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Arhgap20Q6IFT4 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Arhgap20Q6IFT4 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Arhgap20Q6IFT4 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Arhgap20Q6IFT4 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Arhgap20Q6IFT4 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Arhgap20Q6IFT4 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Arhgap20Q6IFT4 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Arhgap20Q6IFT4 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms