Protein–RNA interactions for Protein: Q62443

Nptx1, Neuronal pentraxin-1, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nptx1Q62443 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nptx1Q62443 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Nptx1Q62443 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nptx1Q62443 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nptx1Q62443 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nptx1Q62443 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nptx1Q62443 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nptx1Q62443 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nptx1Q62443 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nptx1Q62443 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nptx1Q62443 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nptx1Q62443 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nptx1Q62443 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nptx1Q62443 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nptx1Q62443 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nptx1Q62443 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Nptx1Q62443 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nptx1Q62443 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nptx1Q62443 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nptx1Q62443 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nptx1Q62443 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nptx1Q62443 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nptx1Q62443 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nptx1Q62443 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nptx1Q62443 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nptx1Q62443 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nptx1Q62443 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nptx1Q62443 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nptx1Q62443 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nptx1Q62443 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nptx1Q62443 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nptx1Q62443 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nptx1Q62443 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nptx1Q62443 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nptx1Q62443 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nptx1Q62443 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nptx1Q62443 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nptx1Q62443 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nptx1Q62443 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nptx1Q62443 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nptx1Q62443 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nptx1Q62443 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nptx1Q62443 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nptx1Q62443 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nptx1Q62443 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nptx1Q62443 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nptx1Q62443 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nptx1Q62443 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nptx1Q62443 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nptx1Q62443 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nptx1Q62443 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Nptx1Q62443 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nptx1Q62443 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Nptx1Q62443 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nptx1Q62443 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nptx1Q62443 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Nptx1Q62443 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nptx1Q62443 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nptx1Q62443 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nptx1Q62443 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nptx1Q62443 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nptx1Q62443 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nptx1Q62443 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nptx1Q62443 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nptx1Q62443 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nptx1Q62443 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nptx1Q62443 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nptx1Q62443 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nptx1Q62443 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nptx1Q62443 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nptx1Q62443 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nptx1Q62443 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nptx1Q62443 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nptx1Q62443 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nptx1Q62443 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nptx1Q62443 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nptx1Q62443 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nptx1Q62443 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nptx1Q62443 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nptx1Q62443 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nptx1Q62443 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nptx1Q62443 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nptx1Q62443 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nptx1Q62443 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nptx1Q62443 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nptx1Q62443 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nptx1Q62443 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nptx1Q62443 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nptx1Q62443 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nptx1Q62443 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nptx1Q62443 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nptx1Q62443 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nptx1Q62443 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nptx1Q62443 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nptx1Q62443 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nptx1Q62443 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nptx1Q62443 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nptx1Q62443 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nptx1Q62443 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nptx1Q62443 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms