Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rbbp4Q60972 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rbbp4Q60972 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rbbp4Q60972 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rbbp4Q60972 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rbbp4Q60972 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rbbp4Q60972 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rbbp4Q60972 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rbbp4Q60972 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rbbp4Q60972 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rbbp4Q60972 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rbbp4Q60972 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rbbp4Q60972 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rbbp4Q60972 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rbbp4Q60972 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rbbp4Q60972 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rbbp4Q60972 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rbbp4Q60972 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rbbp4Q60972 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rbbp4Q60972 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rbbp4Q60972 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rbbp4Q60972 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Rbbp4Q60972 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rbbp4Q60972 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rbbp4Q60972 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rbbp4Q60972 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rbbp4Q60972 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rbbp4Q60972 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rbbp4Q60972 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rbbp4Q60972 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rbbp4Q60972 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rbbp4Q60972 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rbbp4Q60972 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Rbbp4Q60972 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rbbp4Q60972 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rbbp4Q60972 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rbbp4Q60972 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rbbp4Q60972 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rbbp4Q60972 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rbbp4Q60972 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rbbp4Q60972 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Rbbp4Q60972 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rbbp4Q60972 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rbbp4Q60972 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rbbp4Q60972 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rbbp4Q60972 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rbbp4Q60972 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rbbp4Q60972 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rbbp4Q60972 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rbbp4Q60972 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rbbp4Q60972 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rbbp4Q60972 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rbbp4Q60972 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rbbp4Q60972 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rbbp4Q60972 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rbbp4Q60972 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rbbp4Q60972 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rbbp4Q60972 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rbbp4Q60972 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rbbp4Q60972 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rbbp4Q60972 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rbbp4Q60972 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rbbp4Q60972 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rbbp4Q60972 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rbbp4Q60972 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rbbp4Q60972 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rbbp4Q60972 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rbbp4Q60972 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rbbp4Q60972 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rbbp4Q60972 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rbbp4Q60972 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rbbp4Q60972 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rbbp4Q60972 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rbbp4Q60972 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rbbp4Q60972 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rbbp4Q60972 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rbbp4Q60972 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rbbp4Q60972 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rbbp4Q60972 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rbbp4Q60972 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rbbp4Q60972 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rbbp4Q60972 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rbbp4Q60972 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rbbp4Q60972 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rbbp4Q60972 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rbbp4Q60972 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rbbp4Q60972 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rbbp4Q60972 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rbbp4Q60972 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rbbp4Q60972 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rbbp4Q60972 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rbbp4Q60972 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rbbp4Q60972 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rbbp4Q60972 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rbbp4Q60972 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rbbp4Q60972 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rbbp4Q60972 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rbbp4Q60972 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rbbp4Q60972 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rbbp4Q60972 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms