Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4E0

Lhfpl4, LHFPL tetraspan subfamily member 4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhfpl4Q5U4E0 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lhfpl4Q5U4E0 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lhfpl4Q5U4E0 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Lhfpl4Q5U4E0 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lhfpl4Q5U4E0 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lhfpl4Q5U4E0 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lhfpl4Q5U4E0 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lhfpl4Q5U4E0 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lhfpl4Q5U4E0 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lhfpl4Q5U4E0 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lhfpl4Q5U4E0 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lhfpl4Q5U4E0 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lhfpl4Q5U4E0 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lhfpl4Q5U4E0 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lhfpl4Q5U4E0 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lhfpl4Q5U4E0 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lhfpl4Q5U4E0 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lhfpl4Q5U4E0 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lhfpl4Q5U4E0 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lhfpl4Q5U4E0 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lhfpl4Q5U4E0 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lhfpl4Q5U4E0 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lhfpl4Q5U4E0 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lhfpl4Q5U4E0 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lhfpl4Q5U4E0 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lhfpl4Q5U4E0 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lhfpl4Q5U4E0 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lhfpl4Q5U4E0 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lhfpl4Q5U4E0 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lhfpl4Q5U4E0 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Lhfpl4Q5U4E0 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lhfpl4Q5U4E0 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lhfpl4Q5U4E0 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lhfpl4Q5U4E0 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lhfpl4Q5U4E0 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lhfpl4Q5U4E0 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lhfpl4Q5U4E0 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lhfpl4Q5U4E0 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lhfpl4Q5U4E0 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Lhfpl4Q5U4E0 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lhfpl4Q5U4E0 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lhfpl4Q5U4E0 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lhfpl4Q5U4E0 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Lhfpl4Q5U4E0 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lhfpl4Q5U4E0 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lhfpl4Q5U4E0 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lhfpl4Q5U4E0 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lhfpl4Q5U4E0 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lhfpl4Q5U4E0 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lhfpl4Q5U4E0 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lhfpl4Q5U4E0 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lhfpl4Q5U4E0 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lhfpl4Q5U4E0 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lhfpl4Q5U4E0 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lhfpl4Q5U4E0 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lhfpl4Q5U4E0 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lhfpl4Q5U4E0 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lhfpl4Q5U4E0 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Lhfpl4Q5U4E0 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Lhfpl4Q5U4E0 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lhfpl4Q5U4E0 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Lhfpl4Q5U4E0 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Lhfpl4Q5U4E0 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lhfpl4Q5U4E0 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lhfpl4Q5U4E0 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lhfpl4Q5U4E0 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lhfpl4Q5U4E0 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lhfpl4Q5U4E0 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lhfpl4Q5U4E0 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lhfpl4Q5U4E0 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lhfpl4Q5U4E0 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lhfpl4Q5U4E0 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lhfpl4Q5U4E0 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lhfpl4Q5U4E0 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lhfpl4Q5U4E0 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lhfpl4Q5U4E0 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lhfpl4Q5U4E0 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lhfpl4Q5U4E0 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lhfpl4Q5U4E0 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lhfpl4Q5U4E0 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lhfpl4Q5U4E0 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lhfpl4Q5U4E0 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lhfpl4Q5U4E0 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lhfpl4Q5U4E0 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lhfpl4Q5U4E0 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lhfpl4Q5U4E0 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lhfpl4Q5U4E0 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lhfpl4Q5U4E0 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lhfpl4Q5U4E0 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lhfpl4Q5U4E0 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lhfpl4Q5U4E0 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lhfpl4Q5U4E0 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lhfpl4Q5U4E0 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lhfpl4Q5U4E0 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lhfpl4Q5U4E0 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lhfpl4Q5U4E0 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lhfpl4Q5U4E0 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lhfpl4Q5U4E0 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lhfpl4Q5U4E0 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lhfpl4Q5U4E0 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms