Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1A3

Trdv4, T cell receptor delta variable 4 (Fragment), mousemouse

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trdv4Q5R1A3 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Trdv4Q5R1A3 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trdv4Q5R1A3 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trdv4Q5R1A3 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trdv4Q5R1A3 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trdv4Q5R1A3 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trdv4Q5R1A3 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trdv4Q5R1A3 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trdv4Q5R1A3 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trdv4Q5R1A3 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trdv4Q5R1A3 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Trdv4Q5R1A3 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trdv4Q5R1A3 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trdv4Q5R1A3 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trdv4Q5R1A3 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trdv4Q5R1A3 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trdv4Q5R1A3 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trdv4Q5R1A3 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trdv4Q5R1A3 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trdv4Q5R1A3 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trdv4Q5R1A3 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Trdv4Q5R1A3 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Trdv4Q5R1A3 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trdv4Q5R1A3 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trdv4Q5R1A3 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trdv4Q5R1A3 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Trdv4Q5R1A3 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Trdv4Q5R1A3 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trdv4Q5R1A3 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trdv4Q5R1A3 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trdv4Q5R1A3 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Trdv4Q5R1A3 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Trdv4Q5R1A3 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trdv4Q5R1A3 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Trdv4Q5R1A3 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Trdv4Q5R1A3 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trdv4Q5R1A3 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Trdv4Q5R1A3 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Trdv4Q5R1A3 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trdv4Q5R1A3 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trdv4Q5R1A3 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trdv4Q5R1A3 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trdv4Q5R1A3 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Trdv4Q5R1A3 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trdv4Q5R1A3 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trdv4Q5R1A3 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trdv4Q5R1A3 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trdv4Q5R1A3 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trdv4Q5R1A3 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trdv4Q5R1A3 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trdv4Q5R1A3 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trdv4Q5R1A3 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trdv4Q5R1A3 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trdv4Q5R1A3 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trdv4Q5R1A3 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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