Protein–RNA interactions for Protein: Q4V9W2

Srek1ip1, Protein SREK1IP1, mousemouse

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srek1ip1Q4V9W2 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Srek1ip1Q4V9W2 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Srek1ip1Q4V9W2 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Srek1ip1Q4V9W2 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Srek1ip1Q4V9W2 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Srek1ip1Q4V9W2 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Srek1ip1Q4V9W2 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Srek1ip1Q4V9W2 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Srek1ip1Q4V9W2 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Srek1ip1Q4V9W2 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Srek1ip1Q4V9W2 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Srek1ip1Q4V9W2 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Srek1ip1Q4V9W2 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Srek1ip1Q4V9W2 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Srek1ip1Q4V9W2 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Srek1ip1Q4V9W2 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Srek1ip1Q4V9W2 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Srek1ip1Q4V9W2 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Srek1ip1Q4V9W2 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Srek1ip1Q4V9W2 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Srek1ip1Q4V9W2 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Srek1ip1Q4V9W2 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Srek1ip1Q4V9W2 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Srek1ip1Q4V9W2 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Srek1ip1Q4V9W2 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Srek1ip1Q4V9W2 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Srek1ip1Q4V9W2 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Srek1ip1Q4V9W2 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Srek1ip1Q4V9W2 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Srek1ip1Q4V9W2 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Srek1ip1Q4V9W2 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Srek1ip1Q4V9W2 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Srek1ip1Q4V9W2 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Srek1ip1Q4V9W2 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Srek1ip1Q4V9W2 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Srek1ip1Q4V9W2 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Srek1ip1Q4V9W2 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Srek1ip1Q4V9W2 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Srek1ip1Q4V9W2 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Srek1ip1Q4V9W2 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Srek1ip1Q4V9W2 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Srek1ip1Q4V9W2 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Srek1ip1Q4V9W2 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Srek1ip1Q4V9W2 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Srek1ip1Q4V9W2 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Srek1ip1Q4V9W2 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Srek1ip1Q4V9W2 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Srek1ip1Q4V9W2 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Srek1ip1Q4V9W2 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Srek1ip1Q4V9W2 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Srek1ip1Q4V9W2 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Srek1ip1Q4V9W2 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Srek1ip1Q4V9W2 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Srek1ip1Q4V9W2 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Srek1ip1Q4V9W2 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Srek1ip1Q4V9W2 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Srek1ip1Q4V9W2 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Srek1ip1Q4V9W2 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Srek1ip1Q4V9W2 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Srek1ip1Q4V9W2 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Srek1ip1Q4V9W2 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Srek1ip1Q4V9W2 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Srek1ip1Q4V9W2 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Srek1ip1Q4V9W2 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Srek1ip1Q4V9W2 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Srek1ip1Q4V9W2 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Srek1ip1Q4V9W2 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Srek1ip1Q4V9W2 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Srek1ip1Q4V9W2 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Srek1ip1Q4V9W2 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Srek1ip1Q4V9W2 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Srek1ip1Q4V9W2 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Srek1ip1Q4V9W2 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Srek1ip1Q4V9W2 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Srek1ip1Q4V9W2 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Srek1ip1Q4V9W2 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Srek1ip1Q4V9W2 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Srek1ip1Q4V9W2 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Srek1ip1Q4V9W2 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Srek1ip1Q4V9W2 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Srek1ip1Q4V9W2 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Srek1ip1Q4V9W2 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Srek1ip1Q4V9W2 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Srek1ip1Q4V9W2 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Srek1ip1Q4V9W2 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Srek1ip1Q4V9W2 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Srek1ip1Q4V9W2 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Srek1ip1Q4V9W2 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Srek1ip1Q4V9W2 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Srek1ip1Q4V9W2 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Srek1ip1Q4V9W2 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Srek1ip1Q4V9W2 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Srek1ip1Q4V9W2 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Srek1ip1Q4V9W2 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Srek1ip1Q4V9W2 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Srek1ip1Q4V9W2 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Srek1ip1Q4V9W2 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Srek1ip1Q4V9W2 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Srek1ip1Q4V9W2 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Srek1ip1Q4V9W2 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms