Protein–RNA interactions for Protein: Q45VN2

Defa20, Alpha-defensin 20, mousemouse

Predictions only

Length 95 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa20Q45VN2 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Defa20Q45VN2 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Defa20Q45VN2 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Defa20Q45VN2 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Defa20Q45VN2 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Defa20Q45VN2 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Defa20Q45VN2 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Defa20Q45VN2 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Defa20Q45VN2 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Defa20Q45VN2 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Defa20Q45VN2 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Defa20Q45VN2 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Defa20Q45VN2 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Defa20Q45VN2 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Defa20Q45VN2 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Defa20Q45VN2 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Defa20Q45VN2 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Defa20Q45VN2 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Defa20Q45VN2 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Defa20Q45VN2 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Defa20Q45VN2 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Defa20Q45VN2 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Defa20Q45VN2 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Defa20Q45VN2 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Defa20Q45VN2 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Defa20Q45VN2 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Defa20Q45VN2 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Defa20Q45VN2 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Defa20Q45VN2 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Defa20Q45VN2 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Defa20Q45VN2 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Defa20Q45VN2 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Defa20Q45VN2 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Defa20Q45VN2 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Defa20Q45VN2 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Defa20Q45VN2 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Defa20Q45VN2 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Defa20Q45VN2 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Defa20Q45VN2 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Defa20Q45VN2 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.43
Defa20Q45VN2 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Defa20Q45VN2 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Defa20Q45VN2 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Defa20Q45VN2 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Defa20Q45VN2 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Defa20Q45VN2 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Defa20Q45VN2 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Defa20Q45VN2 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Defa20Q45VN2 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Defa20Q45VN2 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Defa20Q45VN2 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Defa20Q45VN2 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Defa20Q45VN2 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Defa20Q45VN2 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Defa20Q45VN2 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Defa20Q45VN2 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Defa20Q45VN2 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Defa20Q45VN2 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Defa20Q45VN2 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Defa20Q45VN2 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Defa20Q45VN2 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Defa20Q45VN2 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Defa20Q45VN2 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Defa20Q45VN2 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Defa20Q45VN2 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Defa20Q45VN2 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Defa20Q45VN2 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Defa20Q45VN2 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Defa20Q45VN2 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Defa20Q45VN2 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Defa20Q45VN2 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Defa20Q45VN2 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Defa20Q45VN2 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Defa20Q45VN2 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Defa20Q45VN2 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Defa20Q45VN2 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Defa20Q45VN2 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Defa20Q45VN2 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Defa20Q45VN2 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Defa20Q45VN2 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Defa20Q45VN2 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Defa20Q45VN2 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Defa20Q45VN2 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Defa20Q45VN2 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Defa20Q45VN2 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Defa20Q45VN2 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Defa20Q45VN2 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Defa20Q45VN2 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Defa20Q45VN2 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Defa20Q45VN2 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Defa20Q45VN2 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Defa20Q45VN2 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Defa20Q45VN2 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Defa20Q45VN2 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Defa20Q45VN2 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Defa20Q45VN2 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Defa20Q45VN2 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Defa20Q45VN2 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Defa20Q45VN2 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Defa20Q45VN2 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.7 ms