Protein–RNA interactions for Protein: Q3V129

Ulk4, Serine/threonine-protein kinase ULK4, mousemouse

Predictions only

Length 1,303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk4Q3V129 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ulk4Q3V129 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ulk4Q3V129 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ulk4Q3V129 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ulk4Q3V129 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ulk4Q3V129 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ulk4Q3V129 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ulk4Q3V129 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Ulk4Q3V129 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ulk4Q3V129 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Ulk4Q3V129 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ulk4Q3V129 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ulk4Q3V129 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ulk4Q3V129 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ulk4Q3V129 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ulk4Q3V129 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ulk4Q3V129 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Ulk4Q3V129 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
Ulk4Q3V129 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ulk4Q3V129 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ulk4Q3V129 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ulk4Q3V129 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ulk4Q3V129 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ulk4Q3V129 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ulk4Q3V129 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ulk4Q3V129 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ulk4Q3V129 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Ulk4Q3V129 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Ulk4Q3V129 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ulk4Q3V129 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ulk4Q3V129 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ulk4Q3V129 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ulk4Q3V129 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ulk4Q3V129 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ulk4Q3V129 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ulk4Q3V129 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ulk4Q3V129 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ulk4Q3V129 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ulk4Q3V129 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ulk4Q3V129 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ulk4Q3V129 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ulk4Q3V129 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ulk4Q3V129 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ulk4Q3V129 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ulk4Q3V129 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ulk4Q3V129 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ulk4Q3V129 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ulk4Q3V129 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ulk4Q3V129 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ulk4Q3V129 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ulk4Q3V129 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ulk4Q3V129 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ulk4Q3V129 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ulk4Q3V129 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ulk4Q3V129 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ulk4Q3V129 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ulk4Q3V129 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ulk4Q3V129 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ulk4Q3V129 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ulk4Q3V129 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ulk4Q3V129 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ulk4Q3V129 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ulk4Q3V129 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ulk4Q3V129 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ulk4Q3V129 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ulk4Q3V129 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ulk4Q3V129 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ulk4Q3V129 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ulk4Q3V129 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ulk4Q3V129 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Ulk4Q3V129 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ulk4Q3V129 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ulk4Q3V129 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ulk4Q3V129 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ulk4Q3V129 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ulk4Q3V129 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ulk4Q3V129 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ulk4Q3V129 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ulk4Q3V129 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ulk4Q3V129 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ulk4Q3V129 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ulk4Q3V129 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ulk4Q3V129 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ulk4Q3V129 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ulk4Q3V129 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ulk4Q3V129 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ulk4Q3V129 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ulk4Q3V129 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ulk4Q3V129 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ulk4Q3V129 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ulk4Q3V129 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ulk4Q3V129 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ulk4Q3V129 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ulk4Q3V129 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ulk4Q3V129 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ulk4Q3V129 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ulk4Q3V129 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ulk4Q3V129 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Ulk4Q3V129 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ulk4Q3V129 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms