Protein–RNA interactions for Protein: Q3V125

Ccdc110, Coiled-coil domain-containing protein 110, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc110Q3V125 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc110Q3V125 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc110Q3V125 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc110Q3V125 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ccdc110Q3V125 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ccdc110Q3V125 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ccdc110Q3V125 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc110Q3V125 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc110Q3V125 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc110Q3V125 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc110Q3V125 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc110Q3V125 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc110Q3V125 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc110Q3V125 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc110Q3V125 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc110Q3V125 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc110Q3V125 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc110Q3V125 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc110Q3V125 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc110Q3V125 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc110Q3V125 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc110Q3V125 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc110Q3V125 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc110Q3V125 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc110Q3V125 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc110Q3V125 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc110Q3V125 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc110Q3V125 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc110Q3V125 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc110Q3V125 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc110Q3V125 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc110Q3V125 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc110Q3V125 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc110Q3V125 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc110Q3V125 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc110Q3V125 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc110Q3V125 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc110Q3V125 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc110Q3V125 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc110Q3V125 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc110Q3V125 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc110Q3V125 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc110Q3V125 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc110Q3V125 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc110Q3V125 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc110Q3V125 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc110Q3V125 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc110Q3V125 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc110Q3V125 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc110Q3V125 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc110Q3V125 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc110Q3V125 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc110Q3V125 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc110Q3V125 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc110Q3V125 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc110Q3V125 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc110Q3V125 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc110Q3V125 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc110Q3V125 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc110Q3V125 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc110Q3V125 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc110Q3V125 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc110Q3V125 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc110Q3V125 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc110Q3V125 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc110Q3V125 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc110Q3V125 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc110Q3V125 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc110Q3V125 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc110Q3V125 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc110Q3V125 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc110Q3V125 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc110Q3V125 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc110Q3V125 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc110Q3V125 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc110Q3V125 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc110Q3V125 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc110Q3V125 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc110Q3V125 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc110Q3V125 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc110Q3V125 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc110Q3V125 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc110Q3V125 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc110Q3V125 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc110Q3V125 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc110Q3V125 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc110Q3V125 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc110Q3V125 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc110Q3V125 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc110Q3V125 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc110Q3V125 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc110Q3V125 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc110Q3V125 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc110Q3V125 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc110Q3V125 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc110Q3V125 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc110Q3V125 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc110Q3V125 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc110Q3V125 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc110Q3V125 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms