Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Usp48Q3V0C5 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Usp48Q3V0C5 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Usp48Q3V0C5 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Usp48Q3V0C5 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Usp48Q3V0C5 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Usp48Q3V0C5 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Usp48Q3V0C5 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Usp48Q3V0C5 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Usp48Q3V0C5 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Usp48Q3V0C5 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Usp48Q3V0C5 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Usp48Q3V0C5 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Usp48Q3V0C5 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Usp48Q3V0C5 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Usp48Q3V0C5 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Usp48Q3V0C5 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Usp48Q3V0C5 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Usp48Q3V0C5 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp48Q3V0C5 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp48Q3V0C5 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp48Q3V0C5 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp48Q3V0C5 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp48Q3V0C5 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp48Q3V0C5 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp48Q3V0C5 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp48Q3V0C5 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Usp48Q3V0C5 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Usp48Q3V0C5 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Usp48Q3V0C5 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Usp48Q3V0C5 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Usp48Q3V0C5 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Usp48Q3V0C5 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Usp48Q3V0C5 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Usp48Q3V0C5 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Usp48Q3V0C5 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Usp48Q3V0C5 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Usp48Q3V0C5 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp48Q3V0C5 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp48Q3V0C5 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp48Q3V0C5 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp48Q3V0C5 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp48Q3V0C5 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp48Q3V0C5 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp48Q3V0C5 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp48Q3V0C5 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp48Q3V0C5 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp48Q3V0C5 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp48Q3V0C5 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp48Q3V0C5 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp48Q3V0C5 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp48Q3V0C5 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp48Q3V0C5 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp48Q3V0C5 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp48Q3V0C5 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp48Q3V0C5 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp48Q3V0C5 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp48Q3V0C5 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp48Q3V0C5 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp48Q3V0C5 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp48Q3V0C5 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp48Q3V0C5 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp48Q3V0C5 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp48Q3V0C5 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp48Q3V0C5 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp48Q3V0C5 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp48Q3V0C5 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp48Q3V0C5 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp48Q3V0C5 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp48Q3V0C5 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp48Q3V0C5 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp48Q3V0C5 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp48Q3V0C5 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp48Q3V0C5 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp48Q3V0C5 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp48Q3V0C5 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Usp48Q3V0C5 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Usp48Q3V0C5 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Usp48Q3V0C5 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Usp48Q3V0C5 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Usp48Q3V0C5 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Usp48Q3V0C5 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Usp48Q3V0C5 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Usp48Q3V0C5 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Usp48Q3V0C5 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Usp48Q3V0C5 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Usp48Q3V0C5 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Usp48Q3V0C5 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Usp48Q3V0C5 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Usp48Q3V0C5 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Usp48Q3V0C5 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Usp48Q3V0C5 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Usp48Q3V0C5 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Usp48Q3V0C5 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Usp48Q3V0C5 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Usp48Q3V0C5 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Usp48Q3V0C5 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Usp48Q3V0C5 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Usp48Q3V0C5 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Usp48Q3V0C5 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms