Protein–RNA interactions for Protein: Q3URY0

Rtl4, Retrotransposon Gag-like protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl4Q3URY0 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rtl4Q3URY0 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rtl4Q3URY0 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rtl4Q3URY0 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rtl4Q3URY0 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rtl4Q3URY0 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rtl4Q3URY0 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rtl4Q3URY0 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rtl4Q3URY0 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rtl4Q3URY0 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rtl4Q3URY0 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rtl4Q3URY0 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rtl4Q3URY0 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rtl4Q3URY0 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rtl4Q3URY0 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rtl4Q3URY0 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rtl4Q3URY0 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rtl4Q3URY0 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rtl4Q3URY0 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rtl4Q3URY0 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rtl4Q3URY0 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Rtl4Q3URY0 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rtl4Q3URY0 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rtl4Q3URY0 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rtl4Q3URY0 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rtl4Q3URY0 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rtl4Q3URY0 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rtl4Q3URY0 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rtl4Q3URY0 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rtl4Q3URY0 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rtl4Q3URY0 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rtl4Q3URY0 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rtl4Q3URY0 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rtl4Q3URY0 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rtl4Q3URY0 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rtl4Q3URY0 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rtl4Q3URY0 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rtl4Q3URY0 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rtl4Q3URY0 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rtl4Q3URY0 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rtl4Q3URY0 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rtl4Q3URY0 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rtl4Q3URY0 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rtl4Q3URY0 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rtl4Q3URY0 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rtl4Q3URY0 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rtl4Q3URY0 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rtl4Q3URY0 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Rtl4Q3URY0 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Rtl4Q3URY0 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rtl4Q3URY0 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rtl4Q3URY0 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rtl4Q3URY0 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rtl4Q3URY0 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rtl4Q3URY0 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rtl4Q3URY0 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rtl4Q3URY0 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rtl4Q3URY0 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rtl4Q3URY0 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rtl4Q3URY0 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rtl4Q3URY0 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rtl4Q3URY0 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rtl4Q3URY0 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rtl4Q3URY0 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Rtl4Q3URY0 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rtl4Q3URY0 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rtl4Q3URY0 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rtl4Q3URY0 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rtl4Q3URY0 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rtl4Q3URY0 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rtl4Q3URY0 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rtl4Q3URY0 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rtl4Q3URY0 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rtl4Q3URY0 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rtl4Q3URY0 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rtl4Q3URY0 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rtl4Q3URY0 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rtl4Q3URY0 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rtl4Q3URY0 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rtl4Q3URY0 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rtl4Q3URY0 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rtl4Q3URY0 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rtl4Q3URY0 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rtl4Q3URY0 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rtl4Q3URY0 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rtl4Q3URY0 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rtl4Q3URY0 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rtl4Q3URY0 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rtl4Q3URY0 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rtl4Q3URY0 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rtl4Q3URY0 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rtl4Q3URY0 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rtl4Q3URY0 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rtl4Q3URY0 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rtl4Q3URY0 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rtl4Q3URY0 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rtl4Q3URY0 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rtl4Q3URY0 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rtl4Q3URY0 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rtl4Q3URY0 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms