Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
E130208F15RikQ3UPV3 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
E130208F15RikQ3UPV3 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
E130208F15RikQ3UPV3 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
E130208F15RikQ3UPV3 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
E130208F15RikQ3UPV3 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
E130208F15RikQ3UPV3 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
E130208F15RikQ3UPV3 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
E130208F15RikQ3UPV3 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
E130208F15RikQ3UPV3 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
E130208F15RikQ3UPV3 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
E130208F15RikQ3UPV3 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
E130208F15RikQ3UPV3 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
E130208F15RikQ3UPV3 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
E130208F15RikQ3UPV3 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
E130208F15RikQ3UPV3 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
E130208F15RikQ3UPV3 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
E130208F15RikQ3UPV3 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
E130208F15RikQ3UPV3 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
E130208F15RikQ3UPV3 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
E130208F15RikQ3UPV3 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
E130208F15RikQ3UPV3 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
E130208F15RikQ3UPV3 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
E130208F15RikQ3UPV3 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
E130208F15RikQ3UPV3 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
E130208F15RikQ3UPV3 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
E130208F15RikQ3UPV3 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
E130208F15RikQ3UPV3 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
E130208F15RikQ3UPV3 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
E130208F15RikQ3UPV3 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
E130208F15RikQ3UPV3 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
E130208F15RikQ3UPV3 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
E130208F15RikQ3UPV3 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
E130208F15RikQ3UPV3 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
E130208F15RikQ3UPV3 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
E130208F15RikQ3UPV3 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
E130208F15RikQ3UPV3 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
E130208F15RikQ3UPV3 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
E130208F15RikQ3UPV3 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
E130208F15RikQ3UPV3 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
E130208F15RikQ3UPV3 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
E130208F15RikQ3UPV3 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
E130208F15RikQ3UPV3 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
E130208F15RikQ3UPV3 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
E130208F15RikQ3UPV3 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
E130208F15RikQ3UPV3 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
E130208F15RikQ3UPV3 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
E130208F15RikQ3UPV3 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
E130208F15RikQ3UPV3 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
E130208F15RikQ3UPV3 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
E130208F15RikQ3UPV3 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
E130208F15RikQ3UPV3 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
E130208F15RikQ3UPV3 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
E130208F15RikQ3UPV3 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
E130208F15RikQ3UPV3 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
E130208F15RikQ3UPV3 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
E130208F15RikQ3UPV3 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
E130208F15RikQ3UPV3 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
E130208F15RikQ3UPV3 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
E130208F15RikQ3UPV3 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
E130208F15RikQ3UPV3 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
E130208F15RikQ3UPV3 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
E130208F15RikQ3UPV3 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
E130208F15RikQ3UPV3 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
E130208F15RikQ3UPV3 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
E130208F15RikQ3UPV3 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
E130208F15RikQ3UPV3 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
E130208F15RikQ3UPV3 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
E130208F15RikQ3UPV3 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
E130208F15RikQ3UPV3 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
E130208F15RikQ3UPV3 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
E130208F15RikQ3UPV3 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
E130208F15RikQ3UPV3 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
E130208F15RikQ3UPV3 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
E130208F15RikQ3UPV3 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
E130208F15RikQ3UPV3 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
E130208F15RikQ3UPV3 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
E130208F15RikQ3UPV3 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
E130208F15RikQ3UPV3 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC12.4□□□□□ -0.43
E130208F15RikQ3UPV3 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
E130208F15RikQ3UPV3 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
E130208F15RikQ3UPV3 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
E130208F15RikQ3UPV3 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
E130208F15RikQ3UPV3 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
E130208F15RikQ3UPV3 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
E130208F15RikQ3UPV3 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
E130208F15RikQ3UPV3 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
E130208F15RikQ3UPV3 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
E130208F15RikQ3UPV3 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
E130208F15RikQ3UPV3 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
E130208F15RikQ3UPV3 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
E130208F15RikQ3UPV3 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
E130208F15RikQ3UPV3 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
E130208F15RikQ3UPV3 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
E130208F15RikQ3UPV3 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
E130208F15RikQ3UPV3 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
E130208F15RikQ3UPV3 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
E130208F15RikQ3UPV3 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms