Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJV1

Ccdc61, Coiled-coil domain-containing protein 61, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc61Q3UJV1 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc61Q3UJV1 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc61Q3UJV1 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc61Q3UJV1 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc61Q3UJV1 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc61Q3UJV1 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc61Q3UJV1 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc61Q3UJV1 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc61Q3UJV1 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc61Q3UJV1 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc61Q3UJV1 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc61Q3UJV1 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc61Q3UJV1 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc61Q3UJV1 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc61Q3UJV1 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc61Q3UJV1 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc61Q3UJV1 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc61Q3UJV1 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc61Q3UJV1 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc61Q3UJV1 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc61Q3UJV1 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc61Q3UJV1 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc61Q3UJV1 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc61Q3UJV1 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc61Q3UJV1 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc61Q3UJV1 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc61Q3UJV1 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc61Q3UJV1 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc61Q3UJV1 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc61Q3UJV1 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc61Q3UJV1 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc61Q3UJV1 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc61Q3UJV1 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc61Q3UJV1 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc61Q3UJV1 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc61Q3UJV1 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc61Q3UJV1 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc61Q3UJV1 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc61Q3UJV1 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc61Q3UJV1 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccdc61Q3UJV1 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccdc61Q3UJV1 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccdc61Q3UJV1 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccdc61Q3UJV1 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccdc61Q3UJV1 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccdc61Q3UJV1 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccdc61Q3UJV1 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc61Q3UJV1 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc61Q3UJV1 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc61Q3UJV1 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc61Q3UJV1 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc61Q3UJV1 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc61Q3UJV1 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc61Q3UJV1 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc61Q3UJV1 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc61Q3UJV1 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc61Q3UJV1 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc61Q3UJV1 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc61Q3UJV1 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc61Q3UJV1 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc61Q3UJV1 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc61Q3UJV1 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc61Q3UJV1 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc61Q3UJV1 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc61Q3UJV1 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc61Q3UJV1 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc61Q3UJV1 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc61Q3UJV1 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc61Q3UJV1 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc61Q3UJV1 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc61Q3UJV1 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc61Q3UJV1 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc61Q3UJV1 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc61Q3UJV1 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc61Q3UJV1 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc61Q3UJV1 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc61Q3UJV1 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc61Q3UJV1 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc61Q3UJV1 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc61Q3UJV1 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc61Q3UJV1 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc61Q3UJV1 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc61Q3UJV1 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc61Q3UJV1 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc61Q3UJV1 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc61Q3UJV1 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc61Q3UJV1 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc61Q3UJV1 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc61Q3UJV1 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc61Q3UJV1 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc61Q3UJV1 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc61Q3UJV1 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc61Q3UJV1 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc61Q3UJV1 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc61Q3UJV1 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc61Q3UJV1 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc61Q3UJV1 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc61Q3UJV1 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc61Q3UJV1 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc61Q3UJV1 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms