Protein–RNA interactions for Protein: Q0VE29

Samd12, Sterile alpha motif domain-containing protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd12Q0VE29 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Samd12Q0VE29 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Samd12Q0VE29 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Samd12Q0VE29 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Samd12Q0VE29 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Samd12Q0VE29 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Samd12Q0VE29 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Samd12Q0VE29 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Samd12Q0VE29 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Samd12Q0VE29 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Samd12Q0VE29 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Samd12Q0VE29 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Samd12Q0VE29 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Samd12Q0VE29 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Samd12Q0VE29 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Samd12Q0VE29 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Samd12Q0VE29 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Samd12Q0VE29 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Samd12Q0VE29 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Samd12Q0VE29 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Samd12Q0VE29 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Samd12Q0VE29 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Samd12Q0VE29 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Samd12Q0VE29 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Samd12Q0VE29 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Samd12Q0VE29 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Samd12Q0VE29 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Samd12Q0VE29 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Samd12Q0VE29 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Samd12Q0VE29 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Samd12Q0VE29 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Samd12Q0VE29 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Samd12Q0VE29 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Samd12Q0VE29 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Samd12Q0VE29 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Samd12Q0VE29 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Samd12Q0VE29 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Samd12Q0VE29 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Samd12Q0VE29 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Samd12Q0VE29 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Samd12Q0VE29 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Samd12Q0VE29 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Samd12Q0VE29 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Samd12Q0VE29 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Samd12Q0VE29 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Samd12Q0VE29 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Samd12Q0VE29 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Samd12Q0VE29 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Samd12Q0VE29 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Samd12Q0VE29 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Samd12Q0VE29 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Samd12Q0VE29 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Samd12Q0VE29 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Samd12Q0VE29 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Samd12Q0VE29 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Samd12Q0VE29 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Samd12Q0VE29 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Samd12Q0VE29 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Samd12Q0VE29 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Samd12Q0VE29 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Samd12Q0VE29 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Samd12Q0VE29 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Samd12Q0VE29 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Samd12Q0VE29 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Samd12Q0VE29 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Samd12Q0VE29 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Samd12Q0VE29 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Samd12Q0VE29 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Samd12Q0VE29 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Samd12Q0VE29 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Samd12Q0VE29 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Samd12Q0VE29 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Samd12Q0VE29 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Samd12Q0VE29 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Samd12Q0VE29 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Samd12Q0VE29 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Samd12Q0VE29 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Samd12Q0VE29 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Samd12Q0VE29 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Samd12Q0VE29 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Samd12Q0VE29 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Samd12Q0VE29 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Samd12Q0VE29 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Samd12Q0VE29 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Samd12Q0VE29 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Samd12Q0VE29 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Samd12Q0VE29 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Samd12Q0VE29 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Samd12Q0VE29 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Samd12Q0VE29 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Samd12Q0VE29 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Samd12Q0VE29 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Samd12Q0VE29 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Samd12Q0VE29 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Samd12Q0VE29 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Samd12Q0VE29 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Samd12Q0VE29 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Samd12Q0VE29 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Samd12Q0VE29 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Samd12Q0VE29 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms