Protein–RNA interactions for Protein: Q08091

Cnn1, Calponin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn1Q08091 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
Cnn1Q08091 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cnn1Q08091 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cnn1Q08091 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cnn1Q08091 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cnn1Q08091 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cnn1Q08091 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cnn1Q08091 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cnn1Q08091 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cnn1Q08091 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cnn1Q08091 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cnn1Q08091 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cnn1Q08091 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cnn1Q08091 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnn1Q08091 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnn1Q08091 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnn1Q08091 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnn1Q08091 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnn1Q08091 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnn1Q08091 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnn1Q08091 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnn1Q08091 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnn1Q08091 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnn1Q08091 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnn1Q08091 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnn1Q08091 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnn1Q08091 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnn1Q08091 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnn1Q08091 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnn1Q08091 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnn1Q08091 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cnn1Q08091 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cnn1Q08091 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cnn1Q08091 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Cnn1Q08091 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cnn1Q08091 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Cnn1Q08091 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Cnn1Q08091 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cnn1Q08091 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cnn1Q08091 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cnn1Q08091 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cnn1Q08091 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cnn1Q08091 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cnn1Q08091 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cnn1Q08091 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cnn1Q08091 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cnn1Q08091 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cnn1Q08091 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cnn1Q08091 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cnn1Q08091 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cnn1Q08091 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cnn1Q08091 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cnn1Q08091 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cnn1Q08091 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cnn1Q08091 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cnn1Q08091 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cnn1Q08091 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cnn1Q08091 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cnn1Q08091 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cnn1Q08091 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cnn1Q08091 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cnn1Q08091 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cnn1Q08091 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cnn1Q08091 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cnn1Q08091 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cnn1Q08091 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cnn1Q08091 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cnn1Q08091 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cnn1Q08091 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cnn1Q08091 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cnn1Q08091 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Cnn1Q08091 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Cnn1Q08091 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cnn1Q08091 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cnn1Q08091 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Cnn1Q08091 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Cnn1Q08091 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cnn1Q08091 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cnn1Q08091 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cnn1Q08091 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cnn1Q08091 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cnn1Q08091 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Cnn1Q08091 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cnn1Q08091 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cnn1Q08091 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cnn1Q08091 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cnn1Q08091 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cnn1Q08091 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cnn1Q08091 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cnn1Q08091 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cnn1Q08091 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cnn1Q08091 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cnn1Q08091 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cnn1Q08091 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cnn1Q08091 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Cnn1Q08091 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cnn1Q08091 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cnn1Q08091 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cnn1Q08091 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cnn1Q08091 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms