Protein–RNA interactions for Protein: Q08024

Cbfb, Core-binding factor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CbfbQ08024 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CbfbQ08024 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CbfbQ08024 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CbfbQ08024 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CbfbQ08024 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CbfbQ08024 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CbfbQ08024 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CbfbQ08024 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CbfbQ08024 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CbfbQ08024 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CbfbQ08024 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CbfbQ08024 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CbfbQ08024 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CbfbQ08024 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CbfbQ08024 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CbfbQ08024 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CbfbQ08024 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CbfbQ08024 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CbfbQ08024 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CbfbQ08024 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CbfbQ08024 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CbfbQ08024 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CbfbQ08024 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CbfbQ08024 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CbfbQ08024 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CbfbQ08024 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CbfbQ08024 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CbfbQ08024 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CbfbQ08024 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CbfbQ08024 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CbfbQ08024 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CbfbQ08024 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CbfbQ08024 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CbfbQ08024 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CbfbQ08024 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CbfbQ08024 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CbfbQ08024 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CbfbQ08024 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CbfbQ08024 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CbfbQ08024 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CbfbQ08024 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CbfbQ08024 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CbfbQ08024 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CbfbQ08024 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CbfbQ08024 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CbfbQ08024 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CbfbQ08024 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CbfbQ08024 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CbfbQ08024 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CbfbQ08024 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CbfbQ08024 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CbfbQ08024 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CbfbQ08024 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CbfbQ08024 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CbfbQ08024 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CbfbQ08024 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CbfbQ08024 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CbfbQ08024 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CbfbQ08024 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CbfbQ08024 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CbfbQ08024 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CbfbQ08024 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CbfbQ08024 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CbfbQ08024 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CbfbQ08024 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CbfbQ08024 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CbfbQ08024 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CbfbQ08024 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CbfbQ08024 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CbfbQ08024 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CbfbQ08024 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CbfbQ08024 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CbfbQ08024 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CbfbQ08024 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CbfbQ08024 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CbfbQ08024 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CbfbQ08024 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CbfbQ08024 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CbfbQ08024 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CbfbQ08024 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CbfbQ08024 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CbfbQ08024 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CbfbQ08024 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CbfbQ08024 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CbfbQ08024 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CbfbQ08024 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CbfbQ08024 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CbfbQ08024 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CbfbQ08024 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CbfbQ08024 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CbfbQ08024 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CbfbQ08024 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CbfbQ08024 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CbfbQ08024 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CbfbQ08024 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CbfbQ08024 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CbfbQ08024 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CbfbQ08024 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CbfbQ08024 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CbfbQ08024 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms