Protein–RNA interactions for Protein: Q06666

Srst, Octapeptide-repeat protein T2, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrstQ06666 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SrstQ06666 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SrstQ06666 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SrstQ06666 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SrstQ06666 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SrstQ06666 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SrstQ06666 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
SrstQ06666 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SrstQ06666 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SrstQ06666 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SrstQ06666 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SrstQ06666 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SrstQ06666 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SrstQ06666 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SrstQ06666 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SrstQ06666 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SrstQ06666 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SrstQ06666 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SrstQ06666 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SrstQ06666 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SrstQ06666 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SrstQ06666 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
SrstQ06666 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SrstQ06666 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SrstQ06666 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SrstQ06666 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SrstQ06666 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SrstQ06666 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SrstQ06666 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SrstQ06666 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SrstQ06666 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
SrstQ06666 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SrstQ06666 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SrstQ06666 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SrstQ06666 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SrstQ06666 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SrstQ06666 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SrstQ06666 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SrstQ06666 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SrstQ06666 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
SrstQ06666 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SrstQ06666 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SrstQ06666 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SrstQ06666 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SrstQ06666 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SrstQ06666 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SrstQ06666 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SrstQ06666 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SrstQ06666 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SrstQ06666 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SrstQ06666 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SrstQ06666 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SrstQ06666 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SrstQ06666 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SrstQ06666 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SrstQ06666 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SrstQ06666 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SrstQ06666 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SrstQ06666 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SrstQ06666 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SrstQ06666 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SrstQ06666 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SrstQ06666 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SrstQ06666 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SrstQ06666 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SrstQ06666 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SrstQ06666 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SrstQ06666 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SrstQ06666 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SrstQ06666 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SrstQ06666 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SrstQ06666 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SrstQ06666 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SrstQ06666 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SrstQ06666 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SrstQ06666 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SrstQ06666 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SrstQ06666 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SrstQ06666 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SrstQ06666 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SrstQ06666 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SrstQ06666 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SrstQ06666 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SrstQ06666 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SrstQ06666 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SrstQ06666 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SrstQ06666 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SrstQ06666 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SrstQ06666 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SrstQ06666 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SrstQ06666 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SrstQ06666 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SrstQ06666 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SrstQ06666 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SrstQ06666 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SrstQ06666 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SrstQ06666 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SrstQ06666 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SrstQ06666 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SrstQ06666 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms