Protein–RNA interactions for Protein: Q05722

Col9a1, Collagen alpha-1(IX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a1Q05722 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Col9a1Q05722 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Col9a1Q05722 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Col9a1Q05722 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Col9a1Q05722 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Col9a1Q05722 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Col9a1Q05722 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Col9a1Q05722 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Col9a1Q05722 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Col9a1Q05722 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Col9a1Q05722 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Col9a1Q05722 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Col9a1Q05722 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Col9a1Q05722 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Col9a1Q05722 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Col9a1Q05722 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Col9a1Q05722 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Col9a1Q05722 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Col9a1Q05722 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Col9a1Q05722 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Col9a1Q05722 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Col9a1Q05722 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Col9a1Q05722 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Col9a1Q05722 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Col9a1Q05722 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Col9a1Q05722 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Col9a1Q05722 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Col9a1Q05722 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Col9a1Q05722 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Col9a1Q05722 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Col9a1Q05722 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Col9a1Q05722 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Col9a1Q05722 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Col9a1Q05722 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Col9a1Q05722 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Col9a1Q05722 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Col9a1Q05722 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Col9a1Q05722 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Col9a1Q05722 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Col9a1Q05722 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Col9a1Q05722 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Col9a1Q05722 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Col9a1Q05722 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Col9a1Q05722 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Col9a1Q05722 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Col9a1Q05722 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Col9a1Q05722 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Col9a1Q05722 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Col9a1Q05722 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Col9a1Q05722 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Col9a1Q05722 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Col9a1Q05722 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Col9a1Q05722 AC073947.1-201ENSMUST00000216991 649 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Col9a1Q05722 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Col9a1Q05722 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Col9a1Q05722 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Col9a1Q05722 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Col9a1Q05722 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Col9a1Q05722 Cisd3-201ENSMUST00000107583 737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Col9a1Q05722 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Col9a1Q05722 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Col9a1Q05722 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Col9a1Q05722 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Col9a1Q05722 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Col9a1Q05722 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Col9a1Q05722 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Col9a1Q05722 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Col9a1Q05722 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Col9a1Q05722 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Col9a1Q05722 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Col9a1Q05722 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Col9a1Q05722 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Col9a1Q05722 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Col9a1Q05722 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Col9a1Q05722 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Col9a1Q05722 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Col9a1Q05722 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Col9a1Q05722 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Col9a1Q05722 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Col9a1Q05722 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Col9a1Q05722 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Col9a1Q05722 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Col9a1Q05722 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Col9a1Q05722 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Col9a1Q05722 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Col9a1Q05722 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Col9a1Q05722 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Col9a1Q05722 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Col9a1Q05722 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Col9a1Q05722 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Col9a1Q05722 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Col9a1Q05722 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Col9a1Q05722 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Col9a1Q05722 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Col9a1Q05722 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Col9a1Q05722 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Col9a1Q05722 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Col9a1Q05722 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Col9a1Q05722 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Col9a1Q05722 Zcwpw2-202ENSMUST00000187329 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms