Protein–RNA interactions for Protein: Q02650

Pax5, Paired box protein Pax-5, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax5Q02650 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pax5Q02650 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pax5Q02650 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pax5Q02650 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pax5Q02650 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pax5Q02650 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pax5Q02650 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pax5Q02650 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pax5Q02650 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pax5Q02650 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pax5Q02650 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pax5Q02650 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pax5Q02650 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Pax5Q02650 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pax5Q02650 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pax5Q02650 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pax5Q02650 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pax5Q02650 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pax5Q02650 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pax5Q02650 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pax5Q02650 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pax5Q02650 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pax5Q02650 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pax5Q02650 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pax5Q02650 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pax5Q02650 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pax5Q02650 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Pax5Q02650 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pax5Q02650 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pax5Q02650 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pax5Q02650 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pax5Q02650 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pax5Q02650 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pax5Q02650 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pax5Q02650 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pax5Q02650 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pax5Q02650 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pax5Q02650 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Pax5Q02650 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pax5Q02650 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pax5Q02650 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pax5Q02650 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pax5Q02650 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pax5Q02650 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Pax5Q02650 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pax5Q02650 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pax5Q02650 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pax5Q02650 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pax5Q02650 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pax5Q02650 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pax5Q02650 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pax5Q02650 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pax5Q02650 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pax5Q02650 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Pax5Q02650 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pax5Q02650 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pax5Q02650 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pax5Q02650 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pax5Q02650 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pax5Q02650 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pax5Q02650 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pax5Q02650 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pax5Q02650 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pax5Q02650 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pax5Q02650 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pax5Q02650 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pax5Q02650 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pax5Q02650 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pax5Q02650 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pax5Q02650 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pax5Q02650 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pax5Q02650 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pax5Q02650 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pax5Q02650 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pax5Q02650 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pax5Q02650 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pax5Q02650 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pax5Q02650 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pax5Q02650 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pax5Q02650 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Pax5Q02650 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pax5Q02650 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pax5Q02650 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pax5Q02650 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pax5Q02650 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pax5Q02650 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pax5Q02650 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pax5Q02650 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pax5Q02650 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pax5Q02650 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pax5Q02650 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pax5Q02650 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Pax5Q02650 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pax5Q02650 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pax5Q02650 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pax5Q02650 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pax5Q02650 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Pax5Q02650 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pax5Q02650 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pax5Q02650 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.3 ms