Protein–RNA interactions for Protein: P97432

Nbr1, Next to BRCA1 gene 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 988 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nbr1P97432 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nbr1P97432 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nbr1P97432 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nbr1P97432 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nbr1P97432 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nbr1P97432 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nbr1P97432 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nbr1P97432 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nbr1P97432 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nbr1P97432 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nbr1P97432 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Nbr1P97432 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nbr1P97432 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nbr1P97432 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nbr1P97432 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nbr1P97432 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nbr1P97432 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nbr1P97432 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nbr1P97432 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nbr1P97432 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nbr1P97432 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nbr1P97432 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nbr1P97432 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nbr1P97432 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nbr1P97432 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nbr1P97432 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nbr1P97432 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nbr1P97432 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nbr1P97432 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Nbr1P97432 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Nbr1P97432 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Nbr1P97432 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Nbr1P97432 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nbr1P97432 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nbr1P97432 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Nbr1P97432 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nbr1P97432 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nbr1P97432 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nbr1P97432 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nbr1P97432 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nbr1P97432 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nbr1P97432 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nbr1P97432 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nbr1P97432 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nbr1P97432 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nbr1P97432 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nbr1P97432 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nbr1P97432 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nbr1P97432 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nbr1P97432 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nbr1P97432 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nbr1P97432 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nbr1P97432 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nbr1P97432 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nbr1P97432 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nbr1P97432 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nbr1P97432 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nbr1P97432 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nbr1P97432 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nbr1P97432 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nbr1P97432 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Nbr1P97432 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nbr1P97432 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nbr1P97432 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nbr1P97432 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nbr1P97432 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nbr1P97432 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nbr1P97432 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nbr1P97432 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nbr1P97432 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nbr1P97432 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nbr1P97432 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nbr1P97432 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nbr1P97432 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nbr1P97432 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nbr1P97432 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nbr1P97432 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nbr1P97432 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nbr1P97432 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nbr1P97432 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nbr1P97432 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nbr1P97432 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Nbr1P97432 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Nbr1P97432 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nbr1P97432 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nbr1P97432 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nbr1P97432 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nbr1P97432 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nbr1P97432 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nbr1P97432 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nbr1P97432 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nbr1P97432 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Nbr1P97432 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nbr1P97432 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nbr1P97432 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nbr1P97432 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nbr1P97432 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nbr1P97432 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nbr1P97432 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nbr1P97432 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms