Protein–RNA interactions for Protein: P97334

Nkx2-3, Homeobox protein Nkx-2.3, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx2-3P97334 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nkx2-3P97334 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nkx2-3P97334 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nkx2-3P97334 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nkx2-3P97334 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nkx2-3P97334 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nkx2-3P97334 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Nkx2-3P97334 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nkx2-3P97334 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nkx2-3P97334 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nkx2-3P97334 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nkx2-3P97334 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nkx2-3P97334 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nkx2-3P97334 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nkx2-3P97334 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nkx2-3P97334 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nkx2-3P97334 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nkx2-3P97334 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nkx2-3P97334 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nkx2-3P97334 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nkx2-3P97334 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Nkx2-3P97334 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Nkx2-3P97334 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Nkx2-3P97334 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Nkx2-3P97334 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Nkx2-3P97334 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nkx2-3P97334 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nkx2-3P97334 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nkx2-3P97334 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Nkx2-3P97334 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nkx2-3P97334 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nkx2-3P97334 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nkx2-3P97334 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nkx2-3P97334 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nkx2-3P97334 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Nkx2-3P97334 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nkx2-3P97334 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nkx2-3P97334 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nkx2-3P97334 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nkx2-3P97334 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nkx2-3P97334 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nkx2-3P97334 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nkx2-3P97334 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nkx2-3P97334 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nkx2-3P97334 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nkx2-3P97334 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nkx2-3P97334 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nkx2-3P97334 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nkx2-3P97334 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nkx2-3P97334 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nkx2-3P97334 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nkx2-3P97334 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nkx2-3P97334 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nkx2-3P97334 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nkx2-3P97334 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nkx2-3P97334 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Nkx2-3P97334 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nkx2-3P97334 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nkx2-3P97334 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nkx2-3P97334 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nkx2-3P97334 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nkx2-3P97334 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nkx2-3P97334 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nkx2-3P97334 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Nkx2-3P97334 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Nkx2-3P97334 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nkx2-3P97334 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nkx2-3P97334 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nkx2-3P97334 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nkx2-3P97334 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nkx2-3P97334 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nkx2-3P97334 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nkx2-3P97334 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nkx2-3P97334 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nkx2-3P97334 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nkx2-3P97334 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nkx2-3P97334 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nkx2-3P97334 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nkx2-3P97334 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nkx2-3P97334 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nkx2-3P97334 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nkx2-3P97334 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nkx2-3P97334 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nkx2-3P97334 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nkx2-3P97334 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nkx2-3P97334 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nkx2-3P97334 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nkx2-3P97334 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nkx2-3P97334 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nkx2-3P97334 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nkx2-3P97334 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Nkx2-3P97334 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nkx2-3P97334 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nkx2-3P97334 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nkx2-3P97334 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Nkx2-3P97334 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nkx2-3P97334 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nkx2-3P97334 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nkx2-3P97334 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nkx2-3P97334 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms