Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Irx1P81068 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Irx1P81068 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Irx1P81068 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Irx1P81068 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Irx1P81068 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Irx1P81068 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Irx1P81068 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Irx1P81068 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Irx1P81068 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Irx1P81068 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Irx1P81068 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Irx1P81068 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Irx1P81068 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Irx1P81068 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Irx1P81068 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Irx1P81068 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Irx1P81068 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Irx1P81068 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Irx1P81068 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Irx1P81068 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Irx1P81068 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Irx1P81068 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Irx1P81068 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Irx1P81068 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Irx1P81068 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Irx1P81068 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Irx1P81068 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Irx1P81068 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Irx1P81068 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Irx1P81068 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Irx1P81068 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Irx1P81068 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Irx1P81068 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Irx1P81068 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Irx1P81068 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Irx1P81068 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Irx1P81068 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Irx1P81068 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Irx1P81068 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Irx1P81068 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Irx1P81068 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Irx1P81068 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Irx1P81068 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Irx1P81068 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Irx1P81068 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Irx1P81068 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Irx1P81068 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Irx1P81068 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Irx1P81068 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Irx1P81068 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Irx1P81068 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Irx1P81068 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Irx1P81068 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Irx1P81068 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Irx1P81068 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Irx1P81068 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Irx1P81068 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Irx1P81068 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Irx1P81068 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Irx1P81068 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Irx1P81068 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Irx1P81068 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Irx1P81068 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Irx1P81068 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Irx1P81068 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Irx1P81068 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Irx1P81068 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Irx1P81068 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Irx1P81068 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Irx1P81068 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Irx1P81068 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Irx1P81068 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Irx1P81068 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Irx1P81068 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Irx1P81068 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Irx1P81068 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Irx1P81068 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Irx1P81068 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Irx1P81068 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Irx1P81068 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Irx1P81068 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Irx1P81068 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Irx1P81068 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Irx1P81068 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Irx1P81068 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Irx1P81068 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Irx1P81068 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Irx1P81068 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Irx1P81068 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Irx1P81068 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Irx1P81068 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Irx1P81068 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Irx1P81068 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Irx1P81068 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Irx1P81068 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Irx1P81068 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Irx1P81068 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Irx1P81068 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Irx1P81068 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms