Protein–RNA interactions for Protein: P70284

Tgif1, Homeobox protein TGIF1, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgif1P70284 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Tgif1P70284 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tgif1P70284 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tgif1P70284 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tgif1P70284 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tgif1P70284 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tgif1P70284 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tgif1P70284 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tgif1P70284 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tgif1P70284 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tgif1P70284 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tgif1P70284 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tgif1P70284 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tgif1P70284 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Tgif1P70284 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tgif1P70284 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tgif1P70284 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tgif1P70284 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tgif1P70284 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tgif1P70284 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tgif1P70284 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tgif1P70284 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tgif1P70284 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tgif1P70284 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tgif1P70284 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tgif1P70284 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tgif1P70284 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tgif1P70284 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tgif1P70284 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tgif1P70284 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tgif1P70284 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tgif1P70284 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tgif1P70284 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tgif1P70284 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tgif1P70284 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tgif1P70284 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tgif1P70284 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tgif1P70284 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tgif1P70284 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tgif1P70284 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tgif1P70284 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tgif1P70284 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tgif1P70284 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tgif1P70284 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tgif1P70284 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Tgif1P70284 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tgif1P70284 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tgif1P70284 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tgif1P70284 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tgif1P70284 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tgif1P70284 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Tgif1P70284 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tgif1P70284 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tgif1P70284 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tgif1P70284 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tgif1P70284 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tgif1P70284 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tgif1P70284 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tgif1P70284 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tgif1P70284 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Tgif1P70284 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tgif1P70284 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tgif1P70284 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tgif1P70284 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tgif1P70284 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tgif1P70284 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tgif1P70284 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tgif1P70284 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tgif1P70284 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tgif1P70284 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tgif1P70284 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tgif1P70284 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tgif1P70284 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tgif1P70284 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tgif1P70284 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tgif1P70284 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tgif1P70284 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tgif1P70284 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tgif1P70284 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tgif1P70284 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tgif1P70284 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tgif1P70284 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tgif1P70284 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tgif1P70284 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tgif1P70284 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tgif1P70284 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tgif1P70284 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tgif1P70284 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tgif1P70284 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tgif1P70284 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tgif1P70284 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Tgif1P70284 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tgif1P70284 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tgif1P70284 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tgif1P70284 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tgif1P70284 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tgif1P70284 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Tgif1P70284 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tgif1P70284 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tgif1P70284 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms