Protein–RNA interactions for Protein: P63013

Prrx1, Paired mesoderm homeobox protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrx1P63013 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Prrx1P63013 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prrx1P63013 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prrx1P63013 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prrx1P63013 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Prrx1P63013 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prrx1P63013 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Prrx1P63013 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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Prrx1P63013 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Prrx1P63013 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prrx1P63013 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prrx1P63013 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prrx1P63013 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prrx1P63013 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prrx1P63013 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Prrx1P63013 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prrx1P63013 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Prrx1P63013 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Prrx1P63013 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prrx1P63013 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prrx1P63013 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prrx1P63013 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Prrx1P63013 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prrx1P63013 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prrx1P63013 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Prrx1P63013 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Prrx1P63013 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prrx1P63013 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prrx1P63013 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prrx1P63013 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prrx1P63013 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prrx1P63013 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Prrx1P63013 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prrx1P63013 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prrx1P63013 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prrx1P63013 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prrx1P63013 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prrx1P63013 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prrx1P63013 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Prrx1P63013 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Prrx1P63013 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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Prrx1P63013 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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Prrx1P63013 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Prrx1P63013 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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Prrx1P63013 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prrx1P63013 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prrx1P63013 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prrx1P63013 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Prrx1P63013 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Prrx1P63013 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prrx1P63013 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Prrx1P63013 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Prrx1P63013 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Prrx1P63013 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Prrx1P63013 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Prrx1P63013 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Prrx1P63013 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Prrx1P63013 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Prrx1P63013 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Prrx1P63013 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Prrx1P63013 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Prrx1P63013 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Prrx1P63013 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Prrx1P63013 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Prrx1P63013 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Prrx1P63013 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
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