Protein–RNA interactions for Protein: P62812

Gabra1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra1P62812 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gabra1P62812 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gabra1P62812 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gabra1P62812 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gabra1P62812 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gabra1P62812 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gabra1P62812 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gabra1P62812 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gabra1P62812 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gabra1P62812 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gabra1P62812 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gabra1P62812 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gabra1P62812 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gabra1P62812 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gabra1P62812 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gabra1P62812 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gabra1P62812 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gabra1P62812 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gabra1P62812 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gabra1P62812 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gabra1P62812 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gabra1P62812 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gabra1P62812 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gabra1P62812 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gabra1P62812 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gabra1P62812 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gabra1P62812 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gabra1P62812 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gabra1P62812 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabra1P62812 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabra1P62812 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabra1P62812 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabra1P62812 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabra1P62812 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabra1P62812 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabra1P62812 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabra1P62812 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabra1P62812 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabra1P62812 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabra1P62812 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabra1P62812 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabra1P62812 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabra1P62812 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabra1P62812 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabra1P62812 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabra1P62812 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabra1P62812 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabra1P62812 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabra1P62812 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabra1P62812 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabra1P62812 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gabra1P62812 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gabra1P62812 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gabra1P62812 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gabra1P62812 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gabra1P62812 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gabra1P62812 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gabra1P62812 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gabra1P62812 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gabra1P62812 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gabra1P62812 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gabra1P62812 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gabra1P62812 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gabra1P62812 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gabra1P62812 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gabra1P62812 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gabra1P62812 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gabra1P62812 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gabra1P62812 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gabra1P62812 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gabra1P62812 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gabra1P62812 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gabra1P62812 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gabra1P62812 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gabra1P62812 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gabra1P62812 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gabra1P62812 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gabra1P62812 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Gabra1P62812 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gabra1P62812 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gabra1P62812 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gabra1P62812 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gabra1P62812 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gabra1P62812 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gabra1P62812 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gabra1P62812 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gabra1P62812 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gabra1P62812 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gabra1P62812 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gabra1P62812 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gabra1P62812 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gabra1P62812 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gabra1P62812 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gabra1P62812 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gabra1P62812 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gabra1P62812 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gabra1P62812 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gabra1P62812 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gabra1P62812 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gabra1P62812 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms