Protein–RNA interactions for Protein: P61021

Rab5b, Ras-related protein Rab-5B, mousemouse

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5bP61021 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab5bP61021 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab5bP61021 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab5bP61021 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab5bP61021 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab5bP61021 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab5bP61021 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab5bP61021 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Rab5bP61021 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab5bP61021 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab5bP61021 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab5bP61021 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab5bP61021 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab5bP61021 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab5bP61021 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab5bP61021 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab5bP61021 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab5bP61021 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab5bP61021 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab5bP61021 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab5bP61021 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab5bP61021 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab5bP61021 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab5bP61021 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab5bP61021 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab5bP61021 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab5bP61021 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab5bP61021 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab5bP61021 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab5bP61021 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab5bP61021 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab5bP61021 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab5bP61021 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab5bP61021 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab5bP61021 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab5bP61021 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab5bP61021 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab5bP61021 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab5bP61021 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab5bP61021 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab5bP61021 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab5bP61021 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab5bP61021 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab5bP61021 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab5bP61021 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab5bP61021 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab5bP61021 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab5bP61021 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab5bP61021 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab5bP61021 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab5bP61021 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab5bP61021 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab5bP61021 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab5bP61021 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab5bP61021 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab5bP61021 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab5bP61021 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab5bP61021 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab5bP61021 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab5bP61021 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab5bP61021 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab5bP61021 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab5bP61021 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab5bP61021 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab5bP61021 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab5bP61021 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab5bP61021 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab5bP61021 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab5bP61021 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab5bP61021 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab5bP61021 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab5bP61021 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab5bP61021 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab5bP61021 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab5bP61021 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab5bP61021 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab5bP61021 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab5bP61021 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab5bP61021 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab5bP61021 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab5bP61021 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab5bP61021 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab5bP61021 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab5bP61021 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab5bP61021 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab5bP61021 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab5bP61021 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab5bP61021 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab5bP61021 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab5bP61021 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab5bP61021 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab5bP61021 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab5bP61021 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab5bP61021 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab5bP61021 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab5bP61021 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab5bP61021 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab5bP61021 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab5bP61021 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab5bP61021 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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