Protein–RNA interactions for Protein: P58801

Ripk2, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 2, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ripk2P58801 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ripk2P58801 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ripk2P58801 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ripk2P58801 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ripk2P58801 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Ripk2P58801 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ripk2P58801 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ripk2P58801 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ripk2P58801 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ripk2P58801 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ripk2P58801 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ripk2P58801 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ripk2P58801 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ripk2P58801 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ripk2P58801 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ripk2P58801 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ripk2P58801 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ripk2P58801 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ripk2P58801 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ripk2P58801 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ripk2P58801 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ripk2P58801 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ripk2P58801 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ripk2P58801 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ripk2P58801 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ripk2P58801 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ripk2P58801 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ripk2P58801 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ripk2P58801 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ripk2P58801 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ripk2P58801 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ripk2P58801 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ripk2P58801 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ripk2P58801 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ripk2P58801 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ripk2P58801 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ripk2P58801 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ripk2P58801 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ripk2P58801 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ripk2P58801 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ripk2P58801 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ripk2P58801 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ripk2P58801 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ripk2P58801 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ripk2P58801 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ripk2P58801 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ripk2P58801 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ripk2P58801 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ripk2P58801 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ripk2P58801 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ripk2P58801 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ripk2P58801 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ripk2P58801 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ripk2P58801 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ripk2P58801 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ripk2P58801 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ripk2P58801 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ripk2P58801 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ripk2P58801 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ripk2P58801 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ripk2P58801 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ripk2P58801 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ripk2P58801 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ripk2P58801 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ripk2P58801 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ripk2P58801 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ripk2P58801 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ripk2P58801 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ripk2P58801 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ripk2P58801 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ripk2P58801 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ripk2P58801 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ripk2P58801 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ripk2P58801 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ripk2P58801 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ripk2P58801 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ripk2P58801 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ripk2P58801 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ripk2P58801 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ripk2P58801 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ripk2P58801 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ripk2P58801 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ripk2P58801 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ripk2P58801 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ripk2P58801 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ripk2P58801 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ripk2P58801 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ripk2P58801 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ripk2P58801 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ripk2P58801 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ripk2P58801 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ripk2P58801 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ripk2P58801 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ripk2P58801 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ripk2P58801 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ripk2P58801 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ripk2P58801 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ripk2P58801 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ripk2P58801 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ripk2P58801 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms