Protein–RNA interactions for Protein: P58774

Tpm2, Tropomyosin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm2P58774 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tpm2P58774 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tpm2P58774 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tpm2P58774 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tpm2P58774 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tpm2P58774 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tpm2P58774 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tpm2P58774 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Tpm2P58774 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tpm2P58774 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tpm2P58774 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tpm2P58774 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tpm2P58774 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tpm2P58774 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tpm2P58774 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tpm2P58774 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tpm2P58774 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tpm2P58774 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tpm2P58774 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tpm2P58774 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tpm2P58774 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tpm2P58774 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tpm2P58774 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tpm2P58774 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tpm2P58774 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tpm2P58774 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tpm2P58774 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tpm2P58774 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tpm2P58774 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tpm2P58774 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tpm2P58774 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tpm2P58774 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tpm2P58774 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
Tpm2P58774 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Tpm2P58774 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Tpm2P58774 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Tpm2P58774 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tpm2P58774 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tpm2P58774 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tpm2P58774 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tpm2P58774 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Tpm2P58774 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tpm2P58774 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tpm2P58774 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tpm2P58774 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tpm2P58774 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tpm2P58774 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tpm2P58774 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tpm2P58774 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tpm2P58774 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Tpm2P58774 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tpm2P58774 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tpm2P58774 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tpm2P58774 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Tpm2P58774 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tpm2P58774 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tpm2P58774 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tpm2P58774 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tpm2P58774 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tpm2P58774 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tpm2P58774 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tpm2P58774 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tpm2P58774 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tpm2P58774 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tpm2P58774 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tpm2P58774 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tpm2P58774 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tpm2P58774 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tpm2P58774 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tpm2P58774 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tpm2P58774 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tpm2P58774 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tpm2P58774 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tpm2P58774 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tpm2P58774 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tpm2P58774 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tpm2P58774 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tpm2P58774 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tpm2P58774 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tpm2P58774 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tpm2P58774 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Tpm2P58774 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tpm2P58774 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tpm2P58774 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tpm2P58774 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tpm2P58774 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tpm2P58774 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tpm2P58774 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tpm2P58774 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tpm2P58774 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tpm2P58774 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tpm2P58774 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tpm2P58774 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tpm2P58774 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tpm2P58774 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tpm2P58774 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tpm2P58774 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tpm2P58774 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tpm2P58774 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tpm2P58774 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms