Protein–RNA interactions for Protein: P57080

Usp25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, mousemouse

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Length 1,055 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp25P57080 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Usp25P57080 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Usp25P57080 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Usp25P57080 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Usp25P57080 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Usp25P57080 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Usp25P57080 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Usp25P57080 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Usp25P57080 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Usp25P57080 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Usp25P57080 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Usp25P57080 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Usp25P57080 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Usp25P57080 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Usp25P57080 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Usp25P57080 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Usp25P57080 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Usp25P57080 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Usp25P57080 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Usp25P57080 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Usp25P57080 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Usp25P57080 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Usp25P57080 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Usp25P57080 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Usp25P57080 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Usp25P57080 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Usp25P57080 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Usp25P57080 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Usp25P57080 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Usp25P57080 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Usp25P57080 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Usp25P57080 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Usp25P57080 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Usp25P57080 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Usp25P57080 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Usp25P57080 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Usp25P57080 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Usp25P57080 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Usp25P57080 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Usp25P57080 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Usp25P57080 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Usp25P57080 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Usp25P57080 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Usp25P57080 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Usp25P57080 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Usp25P57080 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Usp25P57080 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Usp25P57080 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Usp25P57080 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Usp25P57080 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Usp25P57080 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Usp25P57080 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Usp25P57080 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Usp25P57080 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Usp25P57080 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Usp25P57080 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Usp25P57080 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Usp25P57080 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Usp25P57080 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Usp25P57080 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Usp25P57080 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Usp25P57080 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Usp25P57080 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Usp25P57080 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Usp25P57080 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Usp25P57080 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Usp25P57080 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Usp25P57080 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Usp25P57080 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Usp25P57080 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Usp25P57080 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Usp25P57080 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Usp25P57080 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Usp25P57080 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Usp25P57080 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Usp25P57080 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Usp25P57080 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Usp25P57080 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Usp25P57080 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Usp25P57080 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Usp25P57080 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Usp25P57080 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Usp25P57080 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Usp25P57080 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Usp25P57080 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Usp25P57080 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Usp25P57080 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Usp25P57080 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Usp25P57080 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Usp25P57080 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Usp25P57080 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Usp25P57080 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Usp25P57080 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Usp25P57080 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Usp25P57080 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Usp25P57080 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Usp25P57080 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Usp25P57080 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Usp25P57080 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Usp25P57080 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
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