Protein–RNA interactions for Protein: P54726

Rad23a, UV excision repair protein RAD23 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad23aP54726 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Rad23aP54726 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Rad23aP54726 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Rad23aP54726 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Rad23aP54726 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Rad23aP54726 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Rad23aP54726 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Rad23aP54726 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Rad23aP54726 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rad23aP54726 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Rad23aP54726 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rad23aP54726 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rad23aP54726 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rad23aP54726 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rad23aP54726 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rad23aP54726 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rad23aP54726 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rad23aP54726 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rad23aP54726 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rad23aP54726 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rad23aP54726 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rad23aP54726 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rad23aP54726 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Rad23aP54726 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rad23aP54726 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rad23aP54726 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rad23aP54726 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rad23aP54726 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rad23aP54726 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rad23aP54726 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rad23aP54726 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rad23aP54726 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rad23aP54726 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rad23aP54726 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rad23aP54726 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rad23aP54726 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rad23aP54726 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rad23aP54726 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rad23aP54726 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rad23aP54726 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rad23aP54726 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rad23aP54726 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rad23aP54726 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rad23aP54726 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rad23aP54726 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rad23aP54726 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rad23aP54726 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rad23aP54726 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rad23aP54726 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rad23aP54726 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rad23aP54726 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Rad23aP54726 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rad23aP54726 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rad23aP54726 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rad23aP54726 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rad23aP54726 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rad23aP54726 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rad23aP54726 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rad23aP54726 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rad23aP54726 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rad23aP54726 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rad23aP54726 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rad23aP54726 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Rad23aP54726 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rad23aP54726 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rad23aP54726 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rad23aP54726 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rad23aP54726 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rad23aP54726 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rad23aP54726 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rad23aP54726 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Rad23aP54726 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rad23aP54726 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rad23aP54726 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rad23aP54726 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rad23aP54726 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rad23aP54726 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rad23aP54726 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rad23aP54726 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rad23aP54726 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rad23aP54726 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rad23aP54726 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rad23aP54726 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rad23aP54726 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rad23aP54726 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rad23aP54726 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rad23aP54726 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rad23aP54726 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rad23aP54726 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rad23aP54726 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rad23aP54726 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rad23aP54726 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rad23aP54726 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Rad23aP54726 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Rad23aP54726 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rad23aP54726 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rad23aP54726 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rad23aP54726 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rad23aP54726 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rad23aP54726 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.4 ms