Protein–RNA interactions for Protein: P53994

Rab2a, Ras-related protein Rab-2A, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab2aP53994 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab2aP53994 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab2aP53994 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab2aP53994 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab2aP53994 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab2aP53994 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab2aP53994 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab2aP53994 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab2aP53994 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab2aP53994 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab2aP53994 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab2aP53994 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab2aP53994 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab2aP53994 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab2aP53994 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab2aP53994 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab2aP53994 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab2aP53994 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab2aP53994 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab2aP53994 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab2aP53994 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab2aP53994 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab2aP53994 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab2aP53994 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab2aP53994 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab2aP53994 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab2aP53994 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab2aP53994 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab2aP53994 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab2aP53994 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab2aP53994 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab2aP53994 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab2aP53994 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab2aP53994 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab2aP53994 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab2aP53994 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab2aP53994 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab2aP53994 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab2aP53994 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab2aP53994 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab2aP53994 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab2aP53994 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab2aP53994 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab2aP53994 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab2aP53994 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab2aP53994 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab2aP53994 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab2aP53994 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab2aP53994 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab2aP53994 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab2aP53994 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rab2aP53994 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rab2aP53994 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rab2aP53994 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab2aP53994 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab2aP53994 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rab2aP53994 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab2aP53994 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Rab2aP53994 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab2aP53994 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab2aP53994 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab2aP53994 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab2aP53994 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab2aP53994 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rab2aP53994 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rab2aP53994 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab2aP53994 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab2aP53994 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab2aP53994 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab2aP53994 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rab2aP53994 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab2aP53994 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab2aP53994 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab2aP53994 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab2aP53994 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab2aP53994 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab2aP53994 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab2aP53994 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab2aP53994 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab2aP53994 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab2aP53994 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab2aP53994 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab2aP53994 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab2aP53994 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab2aP53994 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Rab2aP53994 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Rab2aP53994 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab2aP53994 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rab2aP53994 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Rab2aP53994 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Rab2aP53994 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab2aP53994 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab2aP53994 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab2aP53994 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab2aP53994 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab2aP53994 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rab2aP53994 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab2aP53994 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Rab2aP53994 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab2aP53994 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms