Protein–RNA interactions for Protein: P50637

Tspo, Translocator protein, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TspoP50637 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TspoP50637 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TspoP50637 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TspoP50637 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TspoP50637 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TspoP50637 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TspoP50637 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TspoP50637 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TspoP50637 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TspoP50637 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TspoP50637 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TspoP50637 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TspoP50637 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TspoP50637 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TspoP50637 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TspoP50637 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TspoP50637 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TspoP50637 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TspoP50637 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TspoP50637 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TspoP50637 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TspoP50637 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TspoP50637 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TspoP50637 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TspoP50637 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TspoP50637 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TspoP50637 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TspoP50637 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TspoP50637 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TspoP50637 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TspoP50637 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TspoP50637 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TspoP50637 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TspoP50637 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TspoP50637 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TspoP50637 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TspoP50637 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TspoP50637 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TspoP50637 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TspoP50637 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TspoP50637 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TspoP50637 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TspoP50637 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TspoP50637 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TspoP50637 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TspoP50637 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TspoP50637 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TspoP50637 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TspoP50637 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TspoP50637 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TspoP50637 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TspoP50637 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TspoP50637 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TspoP50637 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TspoP50637 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TspoP50637 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TspoP50637 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TspoP50637 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TspoP50637 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TspoP50637 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TspoP50637 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TspoP50637 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TspoP50637 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TspoP50637 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TspoP50637 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TspoP50637 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TspoP50637 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TspoP50637 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TspoP50637 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TspoP50637 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TspoP50637 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TspoP50637 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TspoP50637 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TspoP50637 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TspoP50637 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TspoP50637 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TspoP50637 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TspoP50637 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TspoP50637 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TspoP50637 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TspoP50637 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TspoP50637 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TspoP50637 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TspoP50637 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TspoP50637 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TspoP50637 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TspoP50637 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TspoP50637 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TspoP50637 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TspoP50637 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TspoP50637 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TspoP50637 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TspoP50637 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TspoP50637 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TspoP50637 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TspoP50637 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TspoP50637 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TspoP50637 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TspoP50637 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TspoP50637 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms