Protein–RNA interactions for Protein: P50220

Nkx2-1, Homeobox protein Nkx-2.1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx2-1P50220 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nkx2-1P50220 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nkx2-1P50220 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.08■□□□□ 0
Nkx2-1P50220 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nkx2-1P50220 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nkx2-1P50220 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Nkx2-1P50220 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nkx2-1P50220 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nkx2-1P50220 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nkx2-1P50220 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nkx2-1P50220 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Nkx2-1P50220 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nkx2-1P50220 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nkx2-1P50220 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nkx2-1P50220 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nkx2-1P50220 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nkx2-1P50220 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nkx2-1P50220 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nkx2-1P50220 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nkx2-1P50220 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nkx2-1P50220 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Nkx2-1P50220 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nkx2-1P50220 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nkx2-1P50220 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nkx2-1P50220 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nkx2-1P50220 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nkx2-1P50220 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nkx2-1P50220 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nkx2-1P50220 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nkx2-1P50220 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nkx2-1P50220 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nkx2-1P50220 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nkx2-1P50220 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nkx2-1P50220 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nkx2-1P50220 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nkx2-1P50220 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nkx2-1P50220 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nkx2-1P50220 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nkx2-1P50220 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nkx2-1P50220 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nkx2-1P50220 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nkx2-1P50220 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nkx2-1P50220 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nkx2-1P50220 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nkx2-1P50220 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nkx2-1P50220 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nkx2-1P50220 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Nkx2-1P50220 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Nkx2-1P50220 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nkx2-1P50220 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Nkx2-1P50220 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nkx2-1P50220 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nkx2-1P50220 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Nkx2-1P50220 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nkx2-1P50220 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Nkx2-1P50220 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Nkx2-1P50220 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nkx2-1P50220 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nkx2-1P50220 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nkx2-1P50220 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nkx2-1P50220 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nkx2-1P50220 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nkx2-1P50220 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Nkx2-1P50220 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nkx2-1P50220 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nkx2-1P50220 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nkx2-1P50220 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Nkx2-1P50220 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nkx2-1P50220 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nkx2-1P50220 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nkx2-1P50220 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nkx2-1P50220 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Nkx2-1P50220 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nkx2-1P50220 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nkx2-1P50220 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nkx2-1P50220 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Nkx2-1P50220 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Nkx2-1P50220 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Nkx2-1P50220 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nkx2-1P50220 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nkx2-1P50220 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nkx2-1P50220 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nkx2-1P50220 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nkx2-1P50220 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Nkx2-1P50220 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nkx2-1P50220 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Nkx2-1P50220 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nkx2-1P50220 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nkx2-1P50220 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nkx2-1P50220 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Nkx2-1P50220 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nkx2-1P50220 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nkx2-1P50220 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nkx2-1P50220 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nkx2-1P50220 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nkx2-1P50220 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Nkx2-1P50220 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nkx2-1P50220 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nkx2-1P50220 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nkx2-1P50220 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms