Protein–RNA interactions for Protein: P43488

Tnfsf4, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 4, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf4P43488 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tnfsf4P43488 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tnfsf4P43488 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tnfsf4P43488 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tnfsf4P43488 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tnfsf4P43488 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Tnfsf4P43488 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tnfsf4P43488 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tnfsf4P43488 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tnfsf4P43488 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tnfsf4P43488 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tnfsf4P43488 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tnfsf4P43488 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tnfsf4P43488 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tnfsf4P43488 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Tnfsf4P43488 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tnfsf4P43488 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tnfsf4P43488 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tnfsf4P43488 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tnfsf4P43488 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tnfsf4P43488 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tnfsf4P43488 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tnfsf4P43488 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tnfsf4P43488 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tnfsf4P43488 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tnfsf4P43488 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tnfsf4P43488 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tnfsf4P43488 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tnfsf4P43488 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tnfsf4P43488 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tnfsf4P43488 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Tnfsf4P43488 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tnfsf4P43488 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tnfsf4P43488 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tnfsf4P43488 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tnfsf4P43488 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Tnfsf4P43488 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tnfsf4P43488 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tnfsf4P43488 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tnfsf4P43488 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tnfsf4P43488 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tnfsf4P43488 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tnfsf4P43488 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tnfsf4P43488 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tnfsf4P43488 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tnfsf4P43488 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tnfsf4P43488 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tnfsf4P43488 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tnfsf4P43488 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tnfsf4P43488 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tnfsf4P43488 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tnfsf4P43488 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tnfsf4P43488 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tnfsf4P43488 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Tnfsf4P43488 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tnfsf4P43488 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tnfsf4P43488 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tnfsf4P43488 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tnfsf4P43488 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tnfsf4P43488 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tnfsf4P43488 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tnfsf4P43488 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Tnfsf4P43488 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tnfsf4P43488 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tnfsf4P43488 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tnfsf4P43488 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tnfsf4P43488 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tnfsf4P43488 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tnfsf4P43488 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tnfsf4P43488 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tnfsf4P43488 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tnfsf4P43488 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Tnfsf4P43488 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tnfsf4P43488 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tnfsf4P43488 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tnfsf4P43488 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tnfsf4P43488 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tnfsf4P43488 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tnfsf4P43488 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tnfsf4P43488 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tnfsf4P43488 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tnfsf4P43488 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tnfsf4P43488 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tnfsf4P43488 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tnfsf4P43488 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tnfsf4P43488 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tnfsf4P43488 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tnfsf4P43488 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tnfsf4P43488 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tnfsf4P43488 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tnfsf4P43488 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tnfsf4P43488 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
Tnfsf4P43488 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tnfsf4P43488 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tnfsf4P43488 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tnfsf4P43488 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tnfsf4P43488 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tnfsf4P43488 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tnfsf4P43488 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tnfsf4P43488 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms