Protein–RNA interactions for Protein: P40338

Vhl, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VhlP40338 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
VhlP40338 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
VhlP40338 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
VhlP40338 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
VhlP40338 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
VhlP40338 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
VhlP40338 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
VhlP40338 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
VhlP40338 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
VhlP40338 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
VhlP40338 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
VhlP40338 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
VhlP40338 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
VhlP40338 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
VhlP40338 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
VhlP40338 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
VhlP40338 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
VhlP40338 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
VhlP40338 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
VhlP40338 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
VhlP40338 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
VhlP40338 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
VhlP40338 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
VhlP40338 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
VhlP40338 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
VhlP40338 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
VhlP40338 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
VhlP40338 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
VhlP40338 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
VhlP40338 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
VhlP40338 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
VhlP40338 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
VhlP40338 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
VhlP40338 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
VhlP40338 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
VhlP40338 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
VhlP40338 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
VhlP40338 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
VhlP40338 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
VhlP40338 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
VhlP40338 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
VhlP40338 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
VhlP40338 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
VhlP40338 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
VhlP40338 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
VhlP40338 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
VhlP40338 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
VhlP40338 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
VhlP40338 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
VhlP40338 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
VhlP40338 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
VhlP40338 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
VhlP40338 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
VhlP40338 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
VhlP40338 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
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VhlP40338 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
VhlP40338 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
VhlP40338 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
VhlP40338 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
VhlP40338 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
VhlP40338 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
VhlP40338 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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VhlP40338 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
VhlP40338 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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VhlP40338 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
VhlP40338 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
VhlP40338 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
VhlP40338 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
VhlP40338 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
VhlP40338 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
VhlP40338 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
VhlP40338 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
VhlP40338 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
VhlP40338 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
VhlP40338 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
VhlP40338 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
VhlP40338 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
VhlP40338 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
VhlP40338 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
VhlP40338 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
VhlP40338 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
VhlP40338 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
VhlP40338 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
VhlP40338 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
VhlP40338 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
VhlP40338 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
VhlP40338 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
VhlP40338 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
VhlP40338 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
VhlP40338 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
VhlP40338 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
VhlP40338 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
VhlP40338 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
VhlP40338 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
VhlP40338 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms