Protein–RNA interactions for Protein: P35276

Rab3d, Ras-related protein Rab-3D, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3dP35276 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab3dP35276 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab3dP35276 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab3dP35276 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab3dP35276 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab3dP35276 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab3dP35276 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab3dP35276 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab3dP35276 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab3dP35276 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab3dP35276 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab3dP35276 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab3dP35276 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab3dP35276 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab3dP35276 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab3dP35276 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab3dP35276 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab3dP35276 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab3dP35276 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab3dP35276 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab3dP35276 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab3dP35276 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab3dP35276 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab3dP35276 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab3dP35276 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab3dP35276 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rab3dP35276 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rab3dP35276 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rab3dP35276 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rab3dP35276 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab3dP35276 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab3dP35276 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab3dP35276 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab3dP35276 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab3dP35276 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab3dP35276 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab3dP35276 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab3dP35276 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab3dP35276 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab3dP35276 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab3dP35276 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab3dP35276 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab3dP35276 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab3dP35276 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab3dP35276 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab3dP35276 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab3dP35276 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab3dP35276 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab3dP35276 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab3dP35276 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab3dP35276 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab3dP35276 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab3dP35276 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab3dP35276 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab3dP35276 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab3dP35276 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab3dP35276 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab3dP35276 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab3dP35276 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab3dP35276 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab3dP35276 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab3dP35276 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab3dP35276 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab3dP35276 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab3dP35276 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab3dP35276 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab3dP35276 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab3dP35276 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab3dP35276 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab3dP35276 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab3dP35276 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab3dP35276 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab3dP35276 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab3dP35276 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab3dP35276 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab3dP35276 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab3dP35276 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab3dP35276 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab3dP35276 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab3dP35276 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab3dP35276 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab3dP35276 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab3dP35276 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab3dP35276 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab3dP35276 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab3dP35276 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab3dP35276 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab3dP35276 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab3dP35276 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab3dP35276 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab3dP35276 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab3dP35276 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab3dP35276 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab3dP35276 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab3dP35276 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab3dP35276 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab3dP35276 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab3dP35276 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab3dP35276 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab3dP35276 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms