Protein–RNA interactions for Protein: P31041

Cd28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd28P31041 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd28P31041 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd28P31041 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd28P31041 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd28P31041 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd28P31041 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd28P31041 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd28P31041 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd28P31041 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd28P31041 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd28P31041 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd28P31041 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd28P31041 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd28P31041 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd28P31041 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd28P31041 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd28P31041 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd28P31041 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd28P31041 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd28P31041 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd28P31041 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd28P31041 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd28P31041 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd28P31041 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd28P31041 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd28P31041 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd28P31041 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd28P31041 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd28P31041 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd28P31041 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd28P31041 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd28P31041 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd28P31041 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd28P31041 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd28P31041 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd28P31041 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd28P31041 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd28P31041 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd28P31041 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd28P31041 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd28P31041 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd28P31041 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd28P31041 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd28P31041 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd28P31041 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd28P31041 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd28P31041 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd28P31041 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd28P31041 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd28P31041 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd28P31041 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd28P31041 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd28P31041 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd28P31041 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd28P31041 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd28P31041 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd28P31041 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd28P31041 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd28P31041 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd28P31041 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd28P31041 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cd28P31041 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cd28P31041 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cd28P31041 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cd28P31041 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cd28P31041 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cd28P31041 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cd28P31041 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd28P31041 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd28P31041 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd28P31041 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd28P31041 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd28P31041 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd28P31041 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd28P31041 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd28P31041 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd28P31041 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd28P31041 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd28P31041 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd28P31041 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd28P31041 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd28P31041 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd28P31041 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd28P31041 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd28P31041 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd28P31041 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cd28P31041 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd28P31041 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cd28P31041 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd28P31041 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd28P31041 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd28P31041 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd28P31041 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd28P31041 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd28P31041 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd28P31041 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Cd28P31041 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cd28P31041 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd28P31041 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cd28P31041 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms