Protein–RNA interactions for Protein: P28078

H2-DMa, Class II histocompatibility antigen, M alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-DMaP28078 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2-DMaP28078 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
H2-DMaP28078 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2-DMaP28078 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2-DMaP28078 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2-DMaP28078 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2-DMaP28078 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2-DMaP28078 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2-DMaP28078 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
H2-DMaP28078 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2-DMaP28078 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-DMaP28078 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-DMaP28078 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-DMaP28078 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-DMaP28078 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-DMaP28078 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-DMaP28078 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-DMaP28078 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-DMaP28078 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-DMaP28078 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-DMaP28078 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-DMaP28078 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-DMaP28078 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-DMaP28078 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-DMaP28078 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-DMaP28078 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-DMaP28078 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-DMaP28078 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-DMaP28078 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-DMaP28078 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-DMaP28078 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-DMaP28078 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-DMaP28078 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-DMaP28078 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-DMaP28078 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-DMaP28078 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-DMaP28078 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-DMaP28078 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-DMaP28078 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-DMaP28078 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-DMaP28078 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-DMaP28078 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-DMaP28078 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-DMaP28078 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-DMaP28078 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-DMaP28078 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-DMaP28078 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-DMaP28078 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-DMaP28078 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-DMaP28078 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-DMaP28078 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-DMaP28078 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-DMaP28078 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-DMaP28078 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-DMaP28078 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-DMaP28078 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-DMaP28078 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-DMaP28078 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-DMaP28078 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-DMaP28078 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-DMaP28078 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-DMaP28078 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
H2-DMaP28078 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
H2-DMaP28078 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2-DMaP28078 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2-DMaP28078 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2-DMaP28078 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2-DMaP28078 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
H2-DMaP28078 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2-DMaP28078 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2-DMaP28078 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2-DMaP28078 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2-DMaP28078 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2-DMaP28078 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2-DMaP28078 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2-DMaP28078 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2-DMaP28078 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2-DMaP28078 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2-DMaP28078 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2-DMaP28078 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2-DMaP28078 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-DMaP28078 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-DMaP28078 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-DMaP28078 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-DMaP28078 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-DMaP28078 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-DMaP28078 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-DMaP28078 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-DMaP28078 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-DMaP28078 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-DMaP28078 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-DMaP28078 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-DMaP28078 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-DMaP28078 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-DMaP28078 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-DMaP28078 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-DMaP28078 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-DMaP28078 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-DMaP28078 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-DMaP28078 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.1 ms