Protein–RNA interactions for Protein: P27548

Cd40lg, CD40 ligand, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd40lgP27548 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cd40lgP27548 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cd40lgP27548 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cd40lgP27548 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cd40lgP27548 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cd40lgP27548 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cd40lgP27548 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cd40lgP27548 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cd40lgP27548 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cd40lgP27548 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cd40lgP27548 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cd40lgP27548 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cd40lgP27548 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cd40lgP27548 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cd40lgP27548 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cd40lgP27548 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cd40lgP27548 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cd40lgP27548 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cd40lgP27548 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cd40lgP27548 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cd40lgP27548 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cd40lgP27548 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cd40lgP27548 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cd40lgP27548 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cd40lgP27548 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cd40lgP27548 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cd40lgP27548 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cd40lgP27548 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cd40lgP27548 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cd40lgP27548 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cd40lgP27548 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cd40lgP27548 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Cd40lgP27548 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cd40lgP27548 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cd40lgP27548 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cd40lgP27548 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cd40lgP27548 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Cd40lgP27548 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cd40lgP27548 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cd40lgP27548 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cd40lgP27548 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cd40lgP27548 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Cd40lgP27548 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cd40lgP27548 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cd40lgP27548 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cd40lgP27548 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cd40lgP27548 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Cd40lgP27548 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cd40lgP27548 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cd40lgP27548 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cd40lgP27548 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Cd40lgP27548 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cd40lgP27548 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cd40lgP27548 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cd40lgP27548 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cd40lgP27548 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cd40lgP27548 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cd40lgP27548 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cd40lgP27548 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cd40lgP27548 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cd40lgP27548 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cd40lgP27548 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cd40lgP27548 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cd40lgP27548 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cd40lgP27548 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cd40lgP27548 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cd40lgP27548 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cd40lgP27548 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cd40lgP27548 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cd40lgP27548 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cd40lgP27548 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cd40lgP27548 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cd40lgP27548 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cd40lgP27548 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cd40lgP27548 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cd40lgP27548 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cd40lgP27548 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cd40lgP27548 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cd40lgP27548 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cd40lgP27548 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cd40lgP27548 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cd40lgP27548 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cd40lgP27548 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cd40lgP27548 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cd40lgP27548 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cd40lgP27548 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cd40lgP27548 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cd40lgP27548 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cd40lgP27548 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cd40lgP27548 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cd40lgP27548 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cd40lgP27548 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cd40lgP27548 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cd40lgP27548 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cd40lgP27548 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cd40lgP27548 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cd40lgP27548 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cd40lgP27548 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cd40lgP27548 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cd40lgP27548 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms