Protein–RNA interactions for Protein: P18531

Ighv3-6, Ig heavy chain V region 3-6, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ighv3-6P18531 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ighv3-6P18531 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ighv3-6P18531 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ighv3-6P18531 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ighv3-6P18531 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ighv3-6P18531 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ighv3-6P18531 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ighv3-6P18531 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ighv3-6P18531 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ighv3-6P18531 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ighv3-6P18531 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ighv3-6P18531 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ighv3-6P18531 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ighv3-6P18531 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ighv3-6P18531 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ighv3-6P18531 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ighv3-6P18531 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ighv3-6P18531 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ighv3-6P18531 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ighv3-6P18531 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ighv3-6P18531 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ighv3-6P18531 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ighv3-6P18531 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ighv3-6P18531 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ighv3-6P18531 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ighv3-6P18531 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ighv3-6P18531 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ighv3-6P18531 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ighv3-6P18531 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ighv3-6P18531 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ighv3-6P18531 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ighv3-6P18531 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ighv3-6P18531 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ighv3-6P18531 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ighv3-6P18531 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ighv3-6P18531 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ighv3-6P18531 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ighv3-6P18531 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ighv3-6P18531 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ighv3-6P18531 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ighv3-6P18531 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ighv3-6P18531 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ighv3-6P18531 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ighv3-6P18531 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ighv3-6P18531 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ighv3-6P18531 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ighv3-6P18531 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ighv3-6P18531 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ighv3-6P18531 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ighv3-6P18531 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ighv3-6P18531 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ighv3-6P18531 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ighv3-6P18531 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ighv3-6P18531 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ighv3-6P18531 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ighv3-6P18531 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ighv3-6P18531 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ighv3-6P18531 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ighv3-6P18531 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ighv3-6P18531 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ighv3-6P18531 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ighv3-6P18531 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ighv3-6P18531 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ighv3-6P18531 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ighv3-6P18531 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ighv3-6P18531 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ighv3-6P18531 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ighv3-6P18531 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ighv3-6P18531 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ighv3-6P18531 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ighv3-6P18531 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ighv3-6P18531 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ighv3-6P18531 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ighv3-6P18531 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ighv3-6P18531 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ighv3-6P18531 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ighv3-6P18531 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ighv3-6P18531 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ighv3-6P18531 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ighv3-6P18531 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ighv3-6P18531 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ighv3-6P18531 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ighv3-6P18531 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ighv3-6P18531 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ighv3-6P18531 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ighv3-6P18531 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ighv3-6P18531 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ighv3-6P18531 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ighv3-6P18531 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ighv3-6P18531 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ighv3-6P18531 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ighv3-6P18531 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ighv3-6P18531 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ighv3-6P18531 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ighv3-6P18531 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ighv3-6P18531 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ighv3-6P18531 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ighv3-6P18531 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ighv3-6P18531 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ighv3-6P18531 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms