Protein–RNA interactions for Protein: P18526

Ig heavy chain V region 345, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18526 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P18526 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P18526 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P18526 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
P18526 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P18526 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P18526 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P18526 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P18526 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P18526 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P18526 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P18526 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
P18526 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P18526 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P18526 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P18526 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P18526 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P18526 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P18526 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P18526 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P18526 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P18526 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P18526 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P18526 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P18526 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P18526 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P18526 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P18526 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P18526 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P18526 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P18526 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P18526 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P18526 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P18526 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P18526 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P18526 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P18526 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P18526 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P18526 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
P18526 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P18526 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P18526 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P18526 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P18526 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P18526 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P18526 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P18526 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P18526 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P18526 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P18526 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P18526 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P18526 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P18526 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P18526 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P18526 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P18526 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P18526 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P18526 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P18526 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P18526 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
P18526 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P18526 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P18526 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P18526 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P18526 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P18526 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
P18526 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P18526 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P18526 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P18526 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P18526 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P18526 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
P18526 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P18526 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
P18526 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P18526 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P18526 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P18526 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P18526 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P18526 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P18526 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
P18526 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P18526 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P18526 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
P18526 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P18526 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P18526 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P18526 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P18526 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P18526 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P18526 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
P18526 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P18526 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P18526 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P18526 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P18526 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P18526 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
P18526 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P18526 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P18526 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms