Protein–RNA interactions for Protein: P18525

Ig heavy chain V region 5-84, mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18525 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P18525 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
P18525 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P18525 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
P18525 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P18525 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P18525 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P18525 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P18525 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
P18525 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P18525 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P18525 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
P18525 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
P18525 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
P18525 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P18525 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P18525 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P18525 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
P18525 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P18525 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P18525 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P18525 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P18525 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P18525 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
P18525 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P18525 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P18525 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P18525 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
P18525 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P18525 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
P18525 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
P18525 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
P18525 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
P18525 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
P18525 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
P18525 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
P18525 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P18525 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P18525 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P18525 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P18525 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P18525 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
P18525 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P18525 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P18525 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
P18525 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
P18525 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P18525 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P18525 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P18525 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P18525 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
P18525 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P18525 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P18525 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P18525 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P18525 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P18525 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P18525 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P18525 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P18525 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
P18525 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
P18525 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
P18525 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P18525 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P18525 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
P18525 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P18525 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
P18525 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P18525 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P18525 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P18525 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P18525 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P18525 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P18525 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
P18525 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P18525 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
P18525 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
P18525 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
P18525 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P18525 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
P18525 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P18525 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
P18525 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
P18525 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P18525 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P18525 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
P18525 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P18525 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
P18525 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
P18525 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P18525 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P18525 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P18525 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P18525 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P18525 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P18525 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
P18525 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P18525 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P18525 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
P18525 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms