Protein–RNA interactions for Protein: P14427

H2-D1, H-2 class I histocompatibility antigen, D-P alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-D1P14427 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
H2-D1P14427 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
H2-D1P14427 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
H2-D1P14427 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
H2-D1P14427 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
H2-D1P14427 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
H2-D1P14427 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
H2-D1P14427 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
H2-D1P14427 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2-D1P14427 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2-D1P14427 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2-D1P14427 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2-D1P14427 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
H2-D1P14427 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2-D1P14427 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2-D1P14427 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2-D1P14427 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2-D1P14427 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2-D1P14427 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2-D1P14427 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2-D1P14427 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2-D1P14427 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2-D1P14427 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2-D1P14427 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2-D1P14427 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2-D1P14427 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2-D1P14427 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2-D1P14427 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2-D1P14427 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2-D1P14427 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2-D1P14427 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2-D1P14427 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2-D1P14427 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2-D1P14427 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2-D1P14427 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2-D1P14427 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2-D1P14427 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2-D1P14427 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2-D1P14427 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2-D1P14427 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2-D1P14427 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2-D1P14427 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2-D1P14427 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2-D1P14427 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2-D1P14427 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
H2-D1P14427 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2-D1P14427 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2-D1P14427 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2-D1P14427 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2-D1P14427 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2-D1P14427 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2-D1P14427 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2-D1P14427 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2-D1P14427 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2-D1P14427 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2-D1P14427 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2-D1P14427 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
H2-D1P14427 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2-D1P14427 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2-D1P14427 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2-D1P14427 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
H2-D1P14427 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2-D1P14427 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
H2-D1P14427 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2-D1P14427 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2-D1P14427 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2-D1P14427 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2-D1P14427 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
H2-D1P14427 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2-D1P14427 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2-D1P14427 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2-D1P14427 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2-D1P14427 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2-D1P14427 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
H2-D1P14427 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2-D1P14427 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2-D1P14427 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2-D1P14427 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2-D1P14427 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
H2-D1P14427 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
H2-D1P14427 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2-D1P14427 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2-D1P14427 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2-D1P14427 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2-D1P14427 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2-D1P14427 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2-D1P14427 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2-D1P14427 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
H2-D1P14427 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2-D1P14427 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2-D1P14427 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2-D1P14427 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2-D1P14427 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2-D1P14427 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2-D1P14427 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
H2-D1P14427 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
H2-D1P14427 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
H2-D1P14427 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
H2-D1P14427 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
H2-D1P14427 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.2 ms