Protein–RNA interactions for Protein: P11477

Defa1, Alpha-defensin 1, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa1P11477 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Defa1P11477 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Defa1P11477 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Defa1P11477 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Defa1P11477 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Defa1P11477 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Defa1P11477 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Defa1P11477 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Defa1P11477 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Defa1P11477 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Defa1P11477 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Defa1P11477 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Defa1P11477 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Defa1P11477 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Defa1P11477 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Defa1P11477 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Defa1P11477 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Defa1P11477 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Defa1P11477 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Defa1P11477 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Defa1P11477 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Defa1P11477 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Defa1P11477 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Defa1P11477 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Defa1P11477 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Defa1P11477 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Defa1P11477 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Defa1P11477 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Defa1P11477 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Defa1P11477 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Defa1P11477 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Defa1P11477 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Defa1P11477 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Defa1P11477 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Defa1P11477 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Defa1P11477 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Defa1P11477 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Defa1P11477 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Defa1P11477 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Defa1P11477 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Defa1P11477 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Defa1P11477 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Defa1P11477 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Defa1P11477 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Defa1P11477 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Defa1P11477 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Defa1P11477 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Defa1P11477 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Defa1P11477 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Defa1P11477 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Defa1P11477 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Defa1P11477 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Defa1P11477 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Defa1P11477 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Defa1P11477 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Defa1P11477 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Defa1P11477 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Defa1P11477 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Defa1P11477 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Defa1P11477 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Defa1P11477 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Defa1P11477 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Defa1P11477 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Defa1P11477 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Defa1P11477 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Defa1P11477 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Defa1P11477 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Defa1P11477 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Defa1P11477 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Defa1P11477 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Defa1P11477 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Defa1P11477 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Defa1P11477 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Defa1P11477 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Defa1P11477 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Defa1P11477 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Defa1P11477 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Defa1P11477 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Defa1P11477 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Defa1P11477 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Defa1P11477 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Defa1P11477 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Defa1P11477 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Defa1P11477 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Defa1P11477 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Defa1P11477 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Defa1P11477 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Defa1P11477 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Defa1P11477 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Defa1P11477 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Defa1P11477 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Defa1P11477 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Defa1P11477 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Defa1P11477 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Defa1P11477 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Defa1P11477 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Defa1P11477 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Defa1P11477 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Defa1P11477 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Defa1P11477 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.3 ms