Protein–RNA interactions for Protein: P10493

Nid1, Nidogen-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nid1P10493 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nid1P10493 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nid1P10493 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nid1P10493 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nid1P10493 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nid1P10493 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Nid1P10493 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nid1P10493 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nid1P10493 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nid1P10493 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nid1P10493 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nid1P10493 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nid1P10493 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nid1P10493 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nid1P10493 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nid1P10493 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nid1P10493 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nid1P10493 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nid1P10493 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nid1P10493 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nid1P10493 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nid1P10493 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nid1P10493 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nid1P10493 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nid1P10493 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nid1P10493 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nid1P10493 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nid1P10493 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nid1P10493 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nid1P10493 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nid1P10493 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nid1P10493 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nid1P10493 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nid1P10493 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nid1P10493 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nid1P10493 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Nid1P10493 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nid1P10493 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nid1P10493 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nid1P10493 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nid1P10493 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nid1P10493 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nid1P10493 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nid1P10493 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nid1P10493 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nid1P10493 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nid1P10493 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nid1P10493 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nid1P10493 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nid1P10493 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nid1P10493 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nid1P10493 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nid1P10493 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nid1P10493 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nid1P10493 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nid1P10493 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nid1P10493 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nid1P10493 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nid1P10493 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nid1P10493 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nid1P10493 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nid1P10493 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nid1P10493 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nid1P10493 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nid1P10493 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nid1P10493 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nid1P10493 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nid1P10493 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nid1P10493 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nid1P10493 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nid1P10493 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nid1P10493 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nid1P10493 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nid1P10493 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nid1P10493 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nid1P10493 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nid1P10493 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nid1P10493 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nid1P10493 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nid1P10493 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nid1P10493 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nid1P10493 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nid1P10493 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nid1P10493 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nid1P10493 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nid1P10493 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nid1P10493 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nid1P10493 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nid1P10493 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nid1P10493 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nid1P10493 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nid1P10493 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nid1P10493 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nid1P10493 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nid1P10493 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nid1P10493 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nid1P10493 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nid1P10493 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nid1P10493 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nid1P10493 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms