Protein–RNA interactions for Protein: P09925

Surf1, Surfeit locus protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf1P09925 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Surf1P09925 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Surf1P09925 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Surf1P09925 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Surf1P09925 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Surf1P09925 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Surf1P09925 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Surf1P09925 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Surf1P09925 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Surf1P09925 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Surf1P09925 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Surf1P09925 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Surf1P09925 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Surf1P09925 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Surf1P09925 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Surf1P09925 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Surf1P09925 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Surf1P09925 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Surf1P09925 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Surf1P09925 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Surf1P09925 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Surf1P09925 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Surf1P09925 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Surf1P09925 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Surf1P09925 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Surf1P09925 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Surf1P09925 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Surf1P09925 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Surf1P09925 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Surf1P09925 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Surf1P09925 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Surf1P09925 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Surf1P09925 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Surf1P09925 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Surf1P09925 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Surf1P09925 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Surf1P09925 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Surf1P09925 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Surf1P09925 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Surf1P09925 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Surf1P09925 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Surf1P09925 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Surf1P09925 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Surf1P09925 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Surf1P09925 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Surf1P09925 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Surf1P09925 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Surf1P09925 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Surf1P09925 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Surf1P09925 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Surf1P09925 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Surf1P09925 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Surf1P09925 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Surf1P09925 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Surf1P09925 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Surf1P09925 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Surf1P09925 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Surf1P09925 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Surf1P09925 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Surf1P09925 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Surf1P09925 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Surf1P09925 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Surf1P09925 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Surf1P09925 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Surf1P09925 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Surf1P09925 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Surf1P09925 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Surf1P09925 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Surf1P09925 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Surf1P09925 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Surf1P09925 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Surf1P09925 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Surf1P09925 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Surf1P09925 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Surf1P09925 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Surf1P09925 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Surf1P09925 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Surf1P09925 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Surf1P09925 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Surf1P09925 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Surf1P09925 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Surf1P09925 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Surf1P09925 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Surf1P09925 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Surf1P09925 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Surf1P09925 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Surf1P09925 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Surf1P09925 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Surf1P09925 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC20.45■□□□□ 0.87
Surf1P09925 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Surf1P09925 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Surf1P09925 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Surf1P09925 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Surf1P09925 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Surf1P09925 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Surf1P09925 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Surf1P09925 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Surf1P09925 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Surf1P09925 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Surf1P09925 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms