Protein–RNA interactions for Protein: P06801

Me1, NADP-dependent malic enzyme, mousemouse

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Me1P06801 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Me1P06801 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Me1P06801 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Me1P06801 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Me1P06801 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Me1P06801 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Me1P06801 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Me1P06801 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Me1P06801 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Me1P06801 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Me1P06801 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Me1P06801 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Me1P06801 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Me1P06801 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Me1P06801 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Me1P06801 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Me1P06801 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Me1P06801 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Me1P06801 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Me1P06801 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Me1P06801 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Me1P06801 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Me1P06801 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Me1P06801 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Me1P06801 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Me1P06801 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Me1P06801 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Me1P06801 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Me1P06801 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Me1P06801 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Me1P06801 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Me1P06801 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Me1P06801 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Me1P06801 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Me1P06801 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Me1P06801 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Me1P06801 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Me1P06801 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Me1P06801 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Me1P06801 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Me1P06801 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Me1P06801 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Me1P06801 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Me1P06801 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Me1P06801 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Me1P06801 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Me1P06801 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Me1P06801 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Me1P06801 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Me1P06801 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Me1P06801 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Me1P06801 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Me1P06801 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Me1P06801 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Me1P06801 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Me1P06801 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Me1P06801 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Me1P06801 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Me1P06801 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Me1P06801 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Me1P06801 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Me1P06801 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Me1P06801 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Me1P06801 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Me1P06801 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Me1P06801 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Me1P06801 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Me1P06801 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Me1P06801 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Me1P06801 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Me1P06801 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Me1P06801 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Me1P06801 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Me1P06801 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Me1P06801 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Me1P06801 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Me1P06801 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Me1P06801 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Me1P06801 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Me1P06801 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Me1P06801 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Me1P06801 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Me1P06801 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Me1P06801 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Me1P06801 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Me1P06801 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Me1P06801 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Me1P06801 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Me1P06801 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Me1P06801 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Me1P06801 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Me1P06801 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Me1P06801 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Me1P06801 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Me1P06801 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Me1P06801 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Me1P06801 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Me1P06801 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Me1P06801 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Me1P06801 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms