Protein–RNA interactions for Protein: O88792

F11r, Junctional adhesion molecule A, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F11rO88792 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
F11rO88792 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
F11rO88792 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
F11rO88792 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
F11rO88792 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
F11rO88792 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
F11rO88792 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
F11rO88792 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
F11rO88792 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
F11rO88792 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
F11rO88792 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
F11rO88792 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
F11rO88792 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
F11rO88792 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
F11rO88792 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
F11rO88792 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
F11rO88792 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
F11rO88792 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
F11rO88792 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
F11rO88792 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
F11rO88792 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
F11rO88792 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
F11rO88792 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
F11rO88792 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
F11rO88792 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
F11rO88792 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
F11rO88792 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
F11rO88792 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
F11rO88792 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
F11rO88792 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
F11rO88792 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
F11rO88792 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
F11rO88792 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
F11rO88792 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
F11rO88792 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
F11rO88792 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
F11rO88792 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
F11rO88792 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
F11rO88792 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
F11rO88792 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
F11rO88792 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
F11rO88792 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
F11rO88792 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
F11rO88792 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
F11rO88792 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
F11rO88792 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
F11rO88792 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
F11rO88792 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
F11rO88792 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
F11rO88792 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
F11rO88792 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
F11rO88792 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
F11rO88792 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
F11rO88792 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
F11rO88792 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
F11rO88792 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
F11rO88792 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
F11rO88792 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
F11rO88792 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
F11rO88792 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
F11rO88792 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
F11rO88792 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
F11rO88792 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
F11rO88792 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
F11rO88792 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
F11rO88792 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
F11rO88792 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
F11rO88792 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
F11rO88792 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
F11rO88792 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
F11rO88792 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
F11rO88792 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
F11rO88792 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
F11rO88792 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
F11rO88792 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
F11rO88792 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
F11rO88792 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
F11rO88792 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
F11rO88792 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
F11rO88792 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
F11rO88792 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
F11rO88792 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
F11rO88792 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
F11rO88792 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
F11rO88792 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
F11rO88792 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
F11rO88792 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
F11rO88792 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
F11rO88792 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
F11rO88792 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
F11rO88792 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
F11rO88792 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
F11rO88792 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
F11rO88792 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
F11rO88792 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
F11rO88792 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
F11rO88792 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
F11rO88792 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
F11rO88792 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
F11rO88792 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms