Protein–RNA interactions for Protein: O55111

Dsg2, Desmoglein-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg2O55111 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dsg2O55111 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dsg2O55111 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dsg2O55111 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dsg2O55111 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dsg2O55111 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dsg2O55111 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dsg2O55111 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dsg2O55111 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dsg2O55111 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dsg2O55111 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dsg2O55111 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dsg2O55111 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dsg2O55111 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Dsg2O55111 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Dsg2O55111 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Dsg2O55111 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Dsg2O55111 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Dsg2O55111 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Dsg2O55111 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Dsg2O55111 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Dsg2O55111 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Dsg2O55111 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Dsg2O55111 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Dsg2O55111 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Dsg2O55111 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Dsg2O55111 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Dsg2O55111 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Dsg2O55111 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Dsg2O55111 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Dsg2O55111 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Dsg2O55111 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dsg2O55111 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dsg2O55111 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dsg2O55111 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dsg2O55111 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dsg2O55111 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dsg2O55111 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Dsg2O55111 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dsg2O55111 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dsg2O55111 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dsg2O55111 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dsg2O55111 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dsg2O55111 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dsg2O55111 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Dsg2O55111 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.96■□□□□ 0.46
Dsg2O55111 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Dsg2O55111 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Dsg2O55111 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Dsg2O55111 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Dsg2O55111 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Dsg2O55111 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Dsg2O55111 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Dsg2O55111 Gm12953-201ENSMUST00000138426 751 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Dsg2O55111 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Dsg2O55111 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Dsg2O55111 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Dsg2O55111 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Dsg2O55111 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Dsg2O55111 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Dsg2O55111 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Dsg2O55111 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Dsg2O55111 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Dsg2O55111 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Dsg2O55111 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Dsg2O55111 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Dsg2O55111 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Dsg2O55111 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Dsg2O55111 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Dsg2O55111 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Dsg2O55111 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Dsg2O55111 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Dsg2O55111 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Dsg2O55111 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Dsg2O55111 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Dsg2O55111 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Dsg2O55111 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Dsg2O55111 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Dsg2O55111 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Dsg2O55111 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Dsg2O55111 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Dsg2O55111 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Dsg2O55111 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Dsg2O55111 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Dsg2O55111 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Dsg2O55111 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Dsg2O55111 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Dsg2O55111 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Dsg2O55111 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Dsg2O55111 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Dsg2O55111 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Dsg2O55111 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Dsg2O55111 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Dsg2O55111 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Dsg2O55111 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Dsg2O55111 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Dsg2O55111 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Dsg2O55111 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Dsg2O55111 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Dsg2O55111 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms