Protein–RNA interactions for Protein: O55038

Cxcl13, C-X-C motif chemokine 13, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl13O55038 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cxcl13O55038 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cxcl13O55038 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cxcl13O55038 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Cxcl13O55038 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cxcl13O55038 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cxcl13O55038 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cxcl13O55038 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cxcl13O55038 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cxcl13O55038 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cxcl13O55038 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cxcl13O55038 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cxcl13O55038 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cxcl13O55038 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cxcl13O55038 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cxcl13O55038 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cxcl13O55038 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cxcl13O55038 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cxcl13O55038 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cxcl13O55038 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cxcl13O55038 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cxcl13O55038 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cxcl13O55038 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cxcl13O55038 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cxcl13O55038 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cxcl13O55038 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cxcl13O55038 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cxcl13O55038 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cxcl13O55038 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cxcl13O55038 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cxcl13O55038 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cxcl13O55038 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cxcl13O55038 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cxcl13O55038 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cxcl13O55038 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cxcl13O55038 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cxcl13O55038 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cxcl13O55038 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cxcl13O55038 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cxcl13O55038 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cxcl13O55038 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cxcl13O55038 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cxcl13O55038 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cxcl13O55038 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cxcl13O55038 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cxcl13O55038 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cxcl13O55038 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cxcl13O55038 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cxcl13O55038 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cxcl13O55038 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cxcl13O55038 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cxcl13O55038 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cxcl13O55038 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cxcl13O55038 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cxcl13O55038 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cxcl13O55038 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cxcl13O55038 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cxcl13O55038 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cxcl13O55038 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cxcl13O55038 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cxcl13O55038 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cxcl13O55038 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cxcl13O55038 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cxcl13O55038 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cxcl13O55038 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cxcl13O55038 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cxcl13O55038 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cxcl13O55038 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cxcl13O55038 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cxcl13O55038 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cxcl13O55038 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cxcl13O55038 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cxcl13O55038 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cxcl13O55038 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cxcl13O55038 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cxcl13O55038 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cxcl13O55038 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cxcl13O55038 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cxcl13O55038 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cxcl13O55038 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cxcl13O55038 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cxcl13O55038 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cxcl13O55038 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cxcl13O55038 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cxcl13O55038 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cxcl13O55038 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cxcl13O55038 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cxcl13O55038 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cxcl13O55038 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cxcl13O55038 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cxcl13O55038 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cxcl13O55038 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cxcl13O55038 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cxcl13O55038 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cxcl13O55038 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cxcl13O55038 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cxcl13O55038 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cxcl13O55038 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cxcl13O55038 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cxcl13O55038 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms